More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0558 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0558  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
314 aa  645    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  63.19 
 
 
345 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  58.17 
 
 
326 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  59.05 
 
 
361 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  60 
 
 
314 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  57.19 
 
 
321 aa  371  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  57.59 
 
 
321 aa  368  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  56.27 
 
 
321 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  57.65 
 
 
326 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  57.93 
 
 
324 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  54.81 
 
 
338 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  55.63 
 
 
321 aa  362  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  54.49 
 
 
324 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  57.33 
 
 
325 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  54.49 
 
 
324 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  56.01 
 
 
318 aa  359  3e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  56.27 
 
 
334 aa  359  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  56.27 
 
 
321 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  58.94 
 
 
335 aa  358  9e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  56.77 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  58.2 
 
 
314 aa  357  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  56.77 
 
 
324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  56.44 
 
 
324 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  57.89 
 
 
320 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  55.31 
 
 
321 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  53.85 
 
 
324 aa  352  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  54.66 
 
 
321 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  54.34 
 
 
321 aa  351  8e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  57.1 
 
 
324 aa  351  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  57.1 
 
 
324 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  57.33 
 
 
325 aa  348  8e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  54.98 
 
 
313 aa  347  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  54.66 
 
 
322 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0755  thioredoxin reductase  57.23 
 
 
315 aa  345  5e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  56.43 
 
 
314 aa  345  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  54.02 
 
 
331 aa  344  8.999999999999999e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  52.09 
 
 
314 aa  344  8.999999999999999e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  53.05 
 
 
321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  53.9 
 
 
317 aa  342  4e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  54.34 
 
 
323 aa  341  9e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  55.7 
 
 
321 aa  338  5e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  55.7 
 
 
321 aa  338  5e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  52.77 
 
 
311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  53.92 
 
 
316 aa  338  8e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  54.86 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  52.44 
 
 
311 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  52.41 
 
 
335 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  52.09 
 
 
317 aa  334  9e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  52.09 
 
 
312 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  52.96 
 
 
319 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  55.37 
 
 
326 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  54.46 
 
 
332 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  52.44 
 
 
311 aa  332  5e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  53.61 
 
 
316 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  53.61 
 
 
316 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  56.11 
 
 
317 aa  332  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  54.55 
 
 
332 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  53.8 
 
 
322 aa  331  8e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  53.8 
 
 
322 aa  331  8e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  53.47 
 
 
334 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  54.55 
 
 
311 aa  329  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1450  thioredoxin-disulfide reductase  56.77 
 
 
324 aa  329  4e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  54.1 
 
 
348 aa  328  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  52.19 
 
 
317 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  53.67 
 
 
316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2258  thioredoxin reductase  52.66 
 
 
316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000669147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  53.29 
 
 
316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  53.99 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  54.21 
 
 
320 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  53.35 
 
 
316 aa  326  3e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  54.21 
 
 
320 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  54.21 
 
 
320 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  52.88 
 
 
317 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  53.58 
 
 
318 aa  325  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  54.31 
 
 
342 aa  325  8.000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  53.67 
 
 
340 aa  325  9e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  52.98 
 
 
317 aa  324  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  52.65 
 
 
317 aa  324  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  52.72 
 
 
328 aa  324  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  54.55 
 
 
320 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  51.88 
 
 
317 aa  324  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000742143  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  51.56 
 
 
317 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  52.81 
 
 
314 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  51.56 
 
 
317 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  52.81 
 
 
314 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2486  thioredoxin reductase  51.25 
 
 
318 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000100803  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  53.21 
 
 
323 aa  323  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  51.72 
 
 
317 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  54.55 
 
 
346 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  51.41 
 
 
317 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000784195  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2218  thioredoxin reductase  51.41 
 
 
317 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123307  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  53.27 
 
 
319 aa  323  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
311 aa  322  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  51.41 
 
 
317 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1932  thioredoxin reductase  51.41 
 
 
317 aa  322  6e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520435  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2208  thioredoxin reductase  54.9 
 
 
338 aa  321  8e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  52.5 
 
 
317 aa  321  8e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  52.96 
 
 
316 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  53.29 
 
 
319 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  53.89 
 
 
320 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>