More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2188 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  100 
 
 
317 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  97.48 
 
 
317 aa  641    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  100 
 
 
317 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000784195  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2218  thioredoxin reductase  100 
 
 
317 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123307  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  97.79 
 
 
317 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  97.79 
 
 
317 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  97.16 
 
 
317 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2326  thioredoxin reductase  99.68 
 
 
317 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000028573  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  97.48 
 
 
317 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  92.74 
 
 
317 aa  618  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000742143  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1932  thioredoxin reductase  91.8 
 
 
317 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2258  thioredoxin reductase  89.24 
 
 
316 aa  594  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000669147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2124  thioredoxin reductase  88.29 
 
 
316 aa  588  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000128654  normal  0.0108632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  88.92 
 
 
317 aa  588  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2486  thioredoxin reductase  87.66 
 
 
318 aa  584  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000100803  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  87.97 
 
 
316 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  80.95 
 
 
321 aa  544  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  80 
 
 
319 aa  544  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  80.7 
 
 
318 aa  545  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  79.05 
 
 
319 aa  540  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  80.57 
 
 
320 aa  535  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  80.57 
 
 
320 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  80.57 
 
 
320 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  80.32 
 
 
322 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  80 
 
 
321 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  80 
 
 
321 aa  529  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  80 
 
 
321 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  80 
 
 
321 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  80 
 
 
321 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  80 
 
 
321 aa  529  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  80 
 
 
321 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  79.68 
 
 
323 aa  529  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  79.68 
 
 
321 aa  527  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  79.05 
 
 
315 aa  525  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  79.68 
 
 
321 aa  526  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  79.3 
 
 
320 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  79.05 
 
 
322 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  78.66 
 
 
320 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  79.05 
 
 
322 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  79.05 
 
 
322 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  79.05 
 
 
322 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  79.05 
 
 
322 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  76.83 
 
 
319 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  77.46 
 
 
318 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  76.83 
 
 
316 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2209  thioredoxin reductase  77.07 
 
 
316 aa  511  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.247616 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  75.81 
 
 
319 aa  508  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  73.82 
 
 
317 aa  506  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  74.2 
 
 
316 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  74.2 
 
 
316 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  74.52 
 
 
316 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  73.89 
 
 
319 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01640  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding protein  74.92 
 
 
310 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00689976  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  73.63 
 
 
340 aa  481  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  73.95 
 
 
340 aa  483  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  71.84 
 
 
317 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  73.95 
 
 
342 aa  480  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  71.02 
 
 
320 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  71.66 
 
 
320 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  71.66 
 
 
320 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  71.34 
 
 
320 aa  475  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  71.02 
 
 
320 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  71.02 
 
 
320 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  71.02 
 
 
320 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  72.93 
 
 
317 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  70.97 
 
 
352 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  69.21 
 
 
317 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  69.09 
 
 
317 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28230  thioredoxin-disulfide reductase  72.29 
 
 
315 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.75824  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  70.03 
 
 
328 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  70.74 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  70.32 
 
 
316 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  68.57 
 
 
319 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1001  thioredoxin reductase  70.42 
 
 
345 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.24844  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  70.32 
 
 
316 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  70.7 
 
 
317 aa  464  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  69.87 
 
 
316 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  70.83 
 
 
316 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  69.33 
 
 
322 aa  462  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  68.89 
 
 
332 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  69.33 
 
 
322 aa  462  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  69.21 
 
 
316 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  69.01 
 
 
321 aa  458  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  67.51 
 
 
317 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  68.79 
 
 
318 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  68.89 
 
 
314 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  68.91 
 
 
323 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  69.01 
 
 
321 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  68.89 
 
 
320 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  68.89 
 
 
320 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  68.89 
 
 
320 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  67.51 
 
 
317 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0046  thioredoxin reductase  70.29 
 
 
319 aa  456  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  68.27 
 
 
316 aa  454  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0754  thioredoxin reductase  70 
 
 
321 aa  454  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  67.2 
 
 
316 aa  454  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  68.47 
 
 
346 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  68.47 
 
 
320 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  67.2 
 
 
319 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3213  thioredoxin reductase  68.81 
 
 
314 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.166551  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>