More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2208 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2208  thioredoxin reductase  100 
 
 		 338 aa  687    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  80.33 
 
 		 317 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  80.33 
 
 		 312 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  79.02 
 
 		 335 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  75.64 
 
 		 331 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  76.3 
 
 		 313 aa  491  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  74.35 
 
 		 332 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  69.38 
 
 		 321 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  66.78 
 
 		 321 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  66.45 
 
 		 321 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  68.28 
 
 		 314 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  67.64 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  68.18 
 
 		 321 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  67.86 
 
 		 321 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  67.97 
 
 		 321 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  63.52 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  66.23 
 
 		 321 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  64.92 
 
 		 335 aa  408  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  61.68 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  60.94 
 
 		 324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  60.31 
 
 		 324 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  60.31 
 
 		 324 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  66.46 
 
 		 320 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  62.62 
 
 		 325 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  62.5 
 
 		 326 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  57.85 
 
 		 326 aa  391  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  60.76 
 
 		 324 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  61.39 
 
 		 324 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  60.58 
 
 		 324 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  60.77 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  59.24 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  61.17 
 
 		 322 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  60 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  59.87 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  61.97 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  59.62 
 
 		 314 aa  374  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  59.28 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  59.05 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  56.96 
 
 		 316 aa  368  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  56.65 
 
 		 316 aa  368  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  57.01 
 
 		 320 aa  368  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  58.25 
 
 		 323 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  57.01 
 
 		 320 aa  368  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 314 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  59.29 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  55.97 
 
 		 342 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  59.62 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  58.86 
 
 		 317 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  57.69 
 
 		 319 aa  363  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  58.06 
 
 		 361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  61.34 
 
 		 323 aa  362  6e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  58.65 
 
 		 323 aa  361  9e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  58.65 
 
 		 323 aa  361  9e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  54.83 
 
 		 340 aa  361  1e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  60.58 
 
 		 317 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  58.73 
 
 		 316 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  60.38 
 
 		 322 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  54.83 
 
 		 340 aa  358  5e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  60.38 
 
 		 322 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  58.65 
 
 		 316 aa  358  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  56.11 
 
 		 319 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  60.38 
 
 		 322 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  57.69 
 
 		 316 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  56.96 
 
 		 317 aa  357  9.999999999999999e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  60.38 
 
 		 322 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  60.38 
 
 		 322 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  58.41 
 
 		 316 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  59.18 
 
 		 320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  60.19 
 
 		 321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  59.18 
 
 		 320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  59.18 
 
 		 320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  59.87 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  59.87 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  59.87 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  59.87 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  59.87 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  59.87 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  55.52 
 
 		 352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  59.87 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  59.87 
 
 		 321 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  57.05 
 
 		 316 aa  355  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  60.26 
 
 		 316 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3328  thioredoxin reductase  57.01 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  57.05 
 
 		 321 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  57.05 
 
 		 321 aa  352  4e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  59.49 
 
 		 318 aa  352  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  56.33 
 
 		 332 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  56.73 
 
 		 316 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  59.29 
 
 		 320 aa  350  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  57.32 
 
 		 320 aa  350  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  56.52 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2486  thioredoxin reductase  57.37 
 
 		 318 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000100803  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  56.52 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  56.09 
 
 		 316 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  57.63 
 
 		 320 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  57.63 
 
 		 320 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  57.63 
 
 		 320 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  57.63 
 
 		 320 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  57.63 
 
 		 320 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  58.01 
 
 		 316 aa  349  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>