More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3328 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3328  thioredoxin reductase  100 
 
 
318 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  76.9 
 
 
316 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  75.39 
 
 
316 aa  501  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  76.34 
 
 
316 aa  497  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  73.5 
 
 
316 aa  488  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  73.5 
 
 
316 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  73.4 
 
 
318 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  71.84 
 
 
317 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1001  thioredoxin reductase  70.89 
 
 
345 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.24844  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  71.2 
 
 
316 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  71.15 
 
 
317 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  68.91 
 
 
319 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  69.58 
 
 
352 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  67.62 
 
 
319 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  68.59 
 
 
323 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  68.28 
 
 
316 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  67.31 
 
 
320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  65.4 
 
 
320 aa  447  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  65.4 
 
 
320 aa  447  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  66.99 
 
 
316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  68.27 
 
 
317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  66.24 
 
 
316 aa  441  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1758  thioredoxin reductase  67.52 
 
 
326 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.852508  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  64.35 
 
 
319 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  67.3 
 
 
317 aa  441  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  66.67 
 
 
316 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  66.24 
 
 
317 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  66.24 
 
 
317 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  68.99 
 
 
316 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  64.13 
 
 
316 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  65.61 
 
 
316 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  65.71 
 
 
346 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  65.38 
 
 
320 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28230  thioredoxin-disulfide reductase  68.27 
 
 
315 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.75824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  65.38 
 
 
320 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  66.99 
 
 
320 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  65.38 
 
 
320 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  67.09 
 
 
317 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  65.06 
 
 
346 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  65.38 
 
 
320 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
320 aa  434  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  66.24 
 
 
319 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  66.02 
 
 
318 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  65.06 
 
 
320 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  65.06 
 
 
320 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  64.65 
 
 
320 aa  431  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  65.06 
 
 
320 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  65.06 
 
 
320 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0345  thioredoxin reductase  69.23 
 
 
319 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  65.06 
 
 
320 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  65.06 
 
 
320 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  64.44 
 
 
319 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  65.06 
 
 
320 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  65.06 
 
 
320 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  65.81 
 
 
317 aa  433  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  63.81 
 
 
319 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  65.92 
 
 
323 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  65.92 
 
 
323 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  65.4 
 
 
320 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  65.08 
 
 
320 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1118  thioredoxin reductase  65.37 
 
 
316 aa  428  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  65.29 
 
 
320 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  64.42 
 
 
321 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  64.63 
 
 
316 aa  428  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  66.03 
 
 
314 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  64.97 
 
 
333 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  64.47 
 
 
317 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  65.29 
 
 
320 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  65.92 
 
 
318 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  65.29 
 
 
333 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  65.29 
 
 
320 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  63.58 
 
 
317 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  63.55 
 
 
321 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2486  thioredoxin reductase  64.31 
 
 
318 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000100803  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  64.65 
 
 
320 aa  424  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2258  thioredoxin reductase  63.99 
 
 
316 aa  424  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000669147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  64.95 
 
 
316 aa  424  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3801  thioredoxin reductase  65.37 
 
 
328 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  64.01 
 
 
333 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  63.9 
 
 
317 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  64.08 
 
 
317 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01640  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding protein  66.01 
 
 
310 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00689976  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  63.58 
 
 
317 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  64.13 
 
 
321 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  64.74 
 
 
320 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  64.44 
 
 
322 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  63.49 
 
 
315 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  64.13 
 
 
321 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  64.44 
 
 
322 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  63.46 
 
 
342 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  64.13 
 
 
321 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2124  thioredoxin reductase  64.08 
 
 
316 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000128654  normal  0.0108632 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  64.44 
 
 
322 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  64.13 
 
 
321 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  63.67 
 
 
332 aa  421  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  64.74 
 
 
320 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  63.78 
 
 
317 aa  422  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  64.44 
 
 
321 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  64.44 
 
 
322 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  64.31 
 
 
321 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>