More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_13251 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_13401  putative thioredoxin reductase  97.6 
 
 
458 aa  916    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327116  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13251  putative thioredoxin reductase  100 
 
 
458 aa  942    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0680  thioredoxin reductase  65.27 
 
 
457 aa  636    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1247  thioredoxin reductase  95.41 
 
 
458 aa  906    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13151  putative thioredoxin reductase  86.9 
 
 
458 aa  830    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12241  putative thioredoxin reductase  66.52 
 
 
463 aa  631  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0425145  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0758  thioredoxin reductase  67.03 
 
 
458 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18111  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  64.47 
 
 
460 aa  629  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15981  putative thioredoxin reductase  67.03 
 
 
458 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  57.3 
 
 
453 aa  539  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  56.07 
 
 
456 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  55.48 
 
 
458 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  55.82 
 
 
460 aa  521  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  55.46 
 
 
461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  55.46 
 
 
461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  54.46 
 
 
459 aa  482  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  51.85 
 
 
547 aa  482  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  53.42 
 
 
312 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01260  thioredoxin-disulfide reductase, putative  50.32 
 
 
371 aa  319  6e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1633  thioredoxin reductase  48.7 
 
 
349 aa  316  6e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59792  Thioredoxin reductase  50.48 
 
 
319 aa  315  8e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03581  Thioredoxin reductase (EC 1.8.1.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q08GE2]  49.38 
 
 
339 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813979  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  48.88 
 
 
314 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  45.99 
 
 
348 aa  299  7e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  48.56 
 
 
314 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  46.27 
 
 
319 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  46.1 
 
 
334 aa  293  4e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  48.08 
 
 
310 aa  293  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  47.44 
 
 
310 aa  292  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  47.8 
 
 
315 aa  290  3e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  47.02 
 
 
333 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  48.56 
 
 
334 aa  290  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  47.02 
 
 
333 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  47.02 
 
 
333 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
309 aa  289  9e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  47.59 
 
 
359 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  50.77 
 
 
325 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  47.77 
 
 
311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  46.93 
 
 
326 aa  284  3.0000000000000004e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  48.88 
 
 
314 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  45.57 
 
 
318 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  46.08 
 
 
353 aa  283  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  44.52 
 
 
310 aa  282  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  46.23 
 
 
333 aa  281  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  46.75 
 
 
319 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  45.86 
 
 
336 aa  281  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  45.37 
 
 
348 aa  280  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  46.67 
 
 
311 aa  280  4e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  44.87 
 
 
310 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  44.13 
 
 
331 aa  280  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  45.98 
 
 
314 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  48.24 
 
 
309 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  48.73 
 
 
327 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  43.03 
 
 
330 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  45.13 
 
 
322 aa  277  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  47.95 
 
 
329 aa  277  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  46.25 
 
 
320 aa  276  5e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  45.85 
 
 
313 aa  276  6e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  45.54 
 
 
311 aa  275  9e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  48.73 
 
 
318 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  43.71 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  47.6 
 
 
311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  44.69 
 
 
340 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  46.52 
 
 
327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  46.45 
 
 
315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  47.8 
 
 
321 aa  271  1e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  45.31 
 
 
333 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  44.59 
 
 
311 aa  272  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  45 
 
 
320 aa  272  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  46.6 
 
 
323 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  45.98 
 
 
335 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  44.16 
 
 
330 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  46.15 
 
 
314 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  46.86 
 
 
313 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  45.6 
 
 
345 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  46.01 
 
 
316 aa  270  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  44.06 
 
 
318 aa  270  5e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  43.81 
 
 
332 aa  269  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  46.03 
 
 
322 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  43.57 
 
 
325 aa  269  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  45.25 
 
 
313 aa  267  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  45.48 
 
 
361 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  45.13 
 
 
339 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  45.66 
 
 
320 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  44.16 
 
 
330 aa  266  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  45.16 
 
 
333 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  43.79 
 
 
331 aa  266  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  44.74 
 
 
344 aa  266  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  44.41 
 
 
318 aa  266  7e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  45.08 
 
 
313 aa  266  8e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  45.28 
 
 
316 aa  265  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  45.02 
 
 
311 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  41.96 
 
 
361 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  45.14 
 
 
318 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  44.21 
 
 
321 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  44.21 
 
 
321 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  45.48 
 
 
311 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  43.83 
 
 
331 aa  263  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  43.95 
 
 
323 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  44.3 
 
 
332 aa  263  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>