More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1028 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1028  Rhodanese domain protein  100 
 
 
140 aa  288  2e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.006997  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0733  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  39.05 
 
 
247 aa  86.7  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168606  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  31.2 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.46 
 
 
390 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  39.51 
 
 
269 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.62 
 
 
403 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.78 
 
 
398 aa  61.6  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.56 
 
 
399 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.17 
 
 
392 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2774  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
399 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165705  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.67 
 
 
386 aa  60.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.57 
 
 
386 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  35.44 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  36.73 
 
 
390 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  29.25 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.78 
 
 
395 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.8 
 
 
390 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.84 
 
 
390 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.05 
 
 
383 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.46 
 
 
400 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.46 
 
 
400 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.46 
 
 
400 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  35 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.44 
 
 
386 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  31.53 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  35.37 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  34.94 
 
 
123 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  34.94 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.46 
 
 
395 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  29.67 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.74 
 
 
390 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  26.36 
 
 
137 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3354  aminotransferase, class V  31.45 
 
 
759 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  34.41 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  31.15 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.25 
 
 
392 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.58 
 
 
387 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.25 
 
 
392 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.48 
 
 
390 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  30.1 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  32.32 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 
271 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.25 
 
 
397 aa  52  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  33.33 
 
 
393 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1123  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.7 
 
 
396 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  29.67 
 
 
106 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.69 
 
 
393 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
220 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  35.44 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.21 
 
 
393 aa  50.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  33.75 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  30.77 
 
 
377 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  29.11 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  26.8 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  35.16 
 
 
389 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  30.95 
 
 
201 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  31.62 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  29.17 
 
 
280 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  28.21 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  28.57 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0544  aminotransferase class V  29.52 
 
 
761 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  32.22 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  32 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  29.63 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.46 
 
 
566 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.46 
 
 
566 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  27 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  30.63 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  33.33 
 
 
778 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  31.43 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  31.43 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.33 
 
 
390 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.19 
 
 
392 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1506  cysteine desulfurase  31.58 
 
 
753 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  29.82 
 
 
393 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  25.47 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27 
 
 
389 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 
127 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  31.76 
 
 
139 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.1 
 
 
387 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 
128 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  27.27 
 
 
109 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  27.27 
 
 
109 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  29.03 
 
 
126 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  38.1 
 
 
127 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  28.05 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  26.32 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>