More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1188 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1188  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0437  rhodanese domain-containing protein  63.19 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1902  Rhodanese domain protein  51.52 
 
 		 123 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  38.82 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  36.05 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  35.05 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  29.1 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2786  rhodanese-like protein  43.06 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0518115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1937  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.336442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.21 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  43.94 
 
 		 461 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  40.79 
 
 		 464 aa  58.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1899  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.383004  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1456  hypothetical protein  34.12 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  37.5 
 
 		 565 aa  54.7  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  43.53 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  39.44 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  33.87 
 
 		 459 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  37.8 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  28.68 
 
 		 269 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  36.71 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 		 226 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.11 
 
 		 562 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  38.96 
 
 		 454 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  34.21 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  40.28 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  31.07 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.38 
 
 		 377 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  40.3 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 550 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  32.47 
 
 		 423 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  33.33 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 388 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 459 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  38.27 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  32.08 
 
 		 459 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 459 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  28.05 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.73 
 
 		 395 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2916  CoA-disulfide reductase  41.1 
 
 		 547 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0103  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  35.87 
 
 		 565 aa  50.4  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  35.37 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.9 
 
 		 390 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 253 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  36.47 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 221 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  36.11 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0918  Rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.112795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  38.03 
 
 		 459 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.8 
 
 		 348 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 		 459 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4079  hypothetical protein  37.78 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  35.44 
 
 		 271 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.53 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  39.71 
 
 		 460 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  32.97 
 
 		 368 aa  48.5  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  32.97 
 
 		 368 aa  48.5  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 220 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  30 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.57 
 
 		 566 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  32.95 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05707  hypothetical protein  39.73 
 
 		 567 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3752  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.8 
 
 		 551 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0588  putative NADH oxidase  39.73 
 
 		 567 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4642  Rhodanese domain protein  32.91 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.845465  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0585  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.1 
 
 		 569 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  31.58 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 107 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.03 
 
 		 392 aa  47.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  32.93 
 
 		 466 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000099  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.36 
 
 		 567 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  31.91 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0736  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  33.75 
 
 		 554 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  31.08 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0774  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  33.75 
 
 		 554 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28 
 
 		 817 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  39.24 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 459 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 459 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>