More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0918 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0918  Rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
99 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.112795 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2271  Rhodanese domain protein  58.51 
 
 
94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  40.24 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39.77 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  39.02 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  34.78 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  41.38 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.56 
 
 
562 aa  64.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  34.44 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  36.56 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 
220 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 
282 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  31.58 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.62 
 
 
568 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  31.4 
 
 
189 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  27.55 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.75 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  30.93 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  30.93 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.08 
 
 
817 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  27.55 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  32.98 
 
 
280 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  31.11 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 
272 aa  60.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  27.55 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  27.55 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  36.71 
 
 
229 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  30.53 
 
 
110 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  27.55 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  31.58 
 
 
110 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  28.05 
 
 
103 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  32.93 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  32.93 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0541  hypothetical protein  29.21 
 
 
598 aa  58.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.360191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  27.55 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  27.55 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  33.72 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  38.55 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  36.9 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  30.53 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.97 
 
 
348 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  25.51 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  25.51 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  35.62 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  36.9 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  25.51 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  30.11 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
188 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  25.51 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  34.94 
 
 
129 aa  58.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  25.51 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  31.18 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  28.42 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  38.03 
 
 
484 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  38.03 
 
 
484 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.47 
 
 
484 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  31.33 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  34.21 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  31.18 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.03 
 
 
478 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  31.18 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.03 
 
 
478 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.84 
 
 
478 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  38.03 
 
 
478 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  31.18 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.63 
 
 
393 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  26.53 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  45.21 
 
 
102 aa  57  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  34.94 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  28.72 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  31.18 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>