More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0780 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0780  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
133 aa  276  5e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.112392 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2878  Rhodanese domain protein  75.93 
 
 
113 aa  183  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0446  Rhodanese domain protein  46.04 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  41.05 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  36.61 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
216 aa  63.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 
220 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  33.9 
 
 
279 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 
282 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
137 aa  60.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 
197 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  30.97 
 
 
198 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  34.78 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  39.51 
 
 
288 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 
116 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  28.04 
 
 
173 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
277 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  30.7 
 
 
216 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  34.83 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.61 
 
 
123 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  34.52 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  30.93 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  30.28 
 
 
120 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  34.18 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 
277 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  30.39 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  31.76 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  30.34 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  28.23 
 
 
201 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  31.46 
 
 
189 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 
189 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 
122 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  29 
 
 
159 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  31 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  29 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  35.44 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  29.76 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 
225 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 
225 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  29 
 
 
711 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  30.23 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
284 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  30 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  38.67 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  30.97 
 
 
144 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  31.43 
 
 
170 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.77 
 
 
390 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  29 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  28.16 
 
 
197 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 
192 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 
271 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
113 aa  50.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.86 
 
 
148 aa  50.8  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  26.32 
 
 
480 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  27 
 
 
157 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  30.68 
 
 
221 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 
221 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 
221 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  29.76 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 
194 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  32.63 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 
129 aa  50.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  30.11 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  30.17 
 
 
119 aa  50.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  26.89 
 
 
181 aa  50.1  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  33.72 
 
 
280 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  30.84 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 
257 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  31.11 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  31.33 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.33 
 
 
568 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  30.12 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
222 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  29.59 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.48 
 
 
393 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  28.07 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  28 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 
480 aa  48.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  31.87 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  34.67 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  30.68 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  26.73 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  26.73 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.14 
 
 
389 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>