113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2535 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2490  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
143 aa  286  9e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.529165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2535  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
143 aa  286  9e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.187626  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2527  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
143 aa  286  9e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.122265 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.93 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0165  cyclic nucleotide-binding  30.19 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  31.93 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  32.5 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  27.74 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.12 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  29.01 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  36.52 
 
 
369 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.88 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  31.2 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0331  cyclic nucleotide-binding protein  36.75 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  30.97 
 
 
419 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.69 
 
 
168 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.25 
 
 
425 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
425 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  30.51 
 
 
194 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2352  cyclic nucleotide-binding protein  32.08 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674498  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  30.51 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  30.97 
 
 
350 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  31.58 
 
 
583 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  30.51 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  30.83 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  25.2 
 
 
495 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 
265 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  28.7 
 
 
243 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1517  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1612  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4229  hypothetical protein  31.67 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000114025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1180  hypothetical protein  35.48 
 
 
980 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
225 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.81 
 
 
225 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.52 
 
 
219 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  31.07 
 
 
417 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
227 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  25.44 
 
 
357 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.63 
 
 
220 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.85 
 
 
1075 aa  47.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  27.97 
 
 
857 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  26.23 
 
 
322 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  28.81 
 
 
860 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  27.97 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
226 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  37.35 
 
 
222 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  26.52 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1722  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 
454 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.107588  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.12 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0102  cyclic nucleotide-binding protein  32.43 
 
 
430 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1134  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.33 
 
 
364 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.081073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2230  hypothetical protein  35.63 
 
 
356 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  34.02 
 
 
367 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.97 
 
 
224 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  27.19 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4818  cyclic nucleotide-binding protein  37.89 
 
 
332 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931859  normal  0.928656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  34.12 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
228 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  34.29 
 
 
214 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  27.05 
 
 
449 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  28.97 
 
 
226 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1521  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000183504  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1915  cyclic nucleotide-binding protein  36.84 
 
 
329 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal  0.183424 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1298  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  24.56 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000825589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  28.41 
 
 
265 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  26.85 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  28.41 
 
 
265 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.28 
 
 
220 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3897  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
227 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280734  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0090  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247588  normal  0.0443693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.91 
 
 
230 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0386  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 
340 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  27.1 
 
 
224 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
231 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
252 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  36 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  32.99 
 
 
581 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  30.49 
 
 
563 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.43 
 
 
225 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.27 
 
 
487 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 
308 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1689  cyclic nucleotide-binding protein  24.82 
 
 
212 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  24.79 
 
 
435 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  30.51 
 
 
1124 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  32.47 
 
 
412 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  25.76 
 
 
221 aa  41.6  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11017  hypothetical protein  37.8 
 
 
333 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.210732  normal  0.341372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  34.52 
 
 
583 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.69 
 
 
212 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  29.45 
 
 
594 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0880  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.3 
 
 
219 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.812688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.36 
 
 
503 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 
637 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>