113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2911 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  42.94 
 
 
1177 aa  852    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
1171 aa  821    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
1124 aa  2240    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  31.9 
 
 
948 aa  189  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2627  cyclic nucleotide-binding protein  44.97 
 
 
168 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  26.75 
 
 
741 aa  106  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  27.03 
 
 
367 aa  105  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  38.89 
 
 
238 aa  104  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  29 
 
 
715 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  28.57 
 
 
715 aa  98.6  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  38.64 
 
 
736 aa  97.8  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  35.45 
 
 
720 aa  95.9  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  26.28 
 
 
721 aa  90.1  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  28.39 
 
 
715 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  31.39 
 
 
720 aa  86.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  31.22 
 
 
709 aa  85.5  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  28.76 
 
 
714 aa  85.1  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  34.29 
 
 
719 aa  84  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  29.15 
 
 
698 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  25.83 
 
 
413 aa  82  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  29.11 
 
 
715 aa  80.1  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  36.84 
 
 
699 aa  80.1  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  34.56 
 
 
702 aa  77.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  34.06 
 
 
711 aa  76.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  33.33 
 
 
701 aa  77  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  29.38 
 
 
701 aa  77  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  30 
 
 
709 aa  76.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  30 
 
 
714 aa  75.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  33.82 
 
 
701 aa  75.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  27.51 
 
 
707 aa  75.5  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  21.29 
 
 
350 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  29.38 
 
 
696 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  33.81 
 
 
709 aa  71.6  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  33.33 
 
 
720 aa  70.1  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  24.6 
 
 
1040 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  29.73 
 
 
474 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  29.11 
 
 
703 aa  67  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  26.88 
 
 
697 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  30.71 
 
 
688 aa  65.5  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.28 
 
 
1018 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  32.82 
 
 
398 aa  63.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  24.69 
 
 
1018 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  33.98 
 
 
308 aa  61.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
228 aa  60.1  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  25 
 
 
235 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  26.98 
 
 
425 aa  58.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.98 
 
 
425 aa  58.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4021  hypothetical protein  21.96 
 
 
433 aa  57.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.46 
 
 
1018 aa  58.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  27.13 
 
 
419 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003750  sensor histidine kinase  31.11 
 
 
646 aa  55.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.04 
 
 
224 aa  55.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.43 
 
 
220 aa  55.1  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  27.03 
 
 
528 aa  53.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  25.18 
 
 
482 aa  53.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  33.33 
 
 
835 aa  53.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  23.76 
 
 
847 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  23.76 
 
 
847 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  23.76 
 
 
844 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0726  response regulator  31.11 
 
 
651 aa  52  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000761968  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2265  hypothetical protein  28.43 
 
 
413 aa  52  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  28.12 
 
 
482 aa  51.6  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  24 
 
 
838 aa  51.6  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  27.59 
 
 
357 aa  51.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.78 
 
 
225 aa  51.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1753  cyclic nucleotide-binding protein  35.19 
 
 
357 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  23.86 
 
 
825 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4440  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 
575 aa  50.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0105368  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  24.8 
 
 
482 aa  49.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  28.83 
 
 
788 aa  49.3  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 
1056 aa  48.9  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  28.38 
 
 
441 aa  48.9  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.78 
 
 
233 aa  49.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  24.76 
 
 
238 aa  49.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  26.67 
 
 
824 aa  48.9  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  40 
 
 
176 aa  48.5  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  32.86 
 
 
375 aa  48.5  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  33.93 
 
 
359 aa  48.9  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  27.04 
 
 
415 aa  48.5  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
226 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  29.55 
 
 
497 aa  47.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02625  hypothetical protein  28.89 
 
 
646 aa  47.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  26.52 
 
 
412 aa  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 
286 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
249 aa  47  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  30.09 
 
 
378 aa  47.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1174  peptidase M50  32.84 
 
 
375 aa  46.6  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  27.27 
 
 
761 aa  46.6  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  24.03 
 
 
241 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 
229 aa  47.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6433  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29 
 
 
561 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0067  cyclic nucleotide-binding protein  33.75 
 
 
415 aa  46.2  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  23.74 
 
 
322 aa  46.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
225 aa  46.2  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  25.76 
 
 
419 aa  46.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
151 aa  46.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  31.43 
 
 
375 aa  46.6  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.76 
 
 
505 aa  46.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  30.48 
 
 
169 aa  46.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
248 aa  45.8  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>