60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0366 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  100 
 
 		 736 aa  1489    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  29.71 
 
 		 715 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  27.57 
 
 		 715 aa  172  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  29.52 
 
 		 715 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  28.51 
 
 		 720 aa  159  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  29.33 
 
 		 715 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  29.81 
 
 		 711 aa  146  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  26.21 
 
 		 714 aa  145  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  28.37 
 
 		 696 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  28.25 
 
 		 709 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  26.49 
 
 		 709 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  28.12 
 
 		 701 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  27.37 
 
 		 699 aa  128  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  22.77 
 
 		 741 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  26.32 
 
 		 707 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  25.59 
 
 		 721 aa  124  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  28.22 
 
 		 474 aa  122  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  26.26 
 
 		 709 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  27 
 
 		 701 aa  120  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  26.59 
 
 		 703 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  26.33 
 
 		 701 aa  118  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  25.45 
 
 		 702 aa  117  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  26.98 
 
 		 688 aa  111  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  29.12 
 
 		 720 aa  110  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  35.75 
 
 		 720 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  27.42 
 
 		 719 aa  107  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  25.91 
 
 		 714 aa  107  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  26.06 
 
 		 698 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  28.44 
 
 		 367 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  38.64 
 
 		 1124 aa  97.8  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  35.76 
 
 		 1171 aa  94.7  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  34.78 
 
 		 1177 aa  94  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  25.84 
 
 		 697 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  38.24 
 
 		 413 aa  92  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  32.18 
 
 		 824 aa  81.3  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  33.78 
 
 		 398 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  32.43 
 
 		 838 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  31.08 
 
 		 847 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  31.08 
 
 		 844 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  31.08 
 
 		 847 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  34.85 
 
 		 948 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  31.85 
 
 		 825 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  33.56 
 
 		 812 aa  65.1  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  31.54 
 
 		 756 aa  61.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  44.83 
 
 		 235 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1951  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1097 aa  53.9  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00270024  hitchhiker  0.000836755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  27.01 
 
 		 741 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2431  peptidase M50  30.65 
 
 		 410 aa  52  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0730109  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  29.63 
 
 		 176 aa  52  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  26.45 
 
 		 436 aa  52  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  30.88 
 
 		 497 aa  51.6  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2586  peptidase M50  30.6 
 
 		 398 aa  50.8  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0867548  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  32 
 
 		 761 aa  50.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  28.57 
 
 		 350 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  32.31 
 
 		 238 aa  49.3  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  21.52 
 
 		 372 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  21.52 
 
 		 372 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  23.3 
 
 		 368 aa  47.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  24.7 
 
 		 347 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  23.1 
 
 		 368 aa  45.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>