50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2708 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  72.06 
 
 		 838 aa  1103    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  100 
 
 		 844 aa  1682    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  69.95 
 
 		 825 aa  1114    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  99.76 
 
 		 847 aa  1678    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  50.24 
 
 		 824 aa  757    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  55.08 
 
 		 812 aa  729    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  99.76 
 
 		 847 aa  1678    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  40.78 
 
 		 761 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  37.3 
 
 		 497 aa  249  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  21.61 
 
 		 413 aa  101  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  28.73 
 
 		 709 aa  75.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  34.71 
 
 		 719 aa  74.3  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  24.48 
 
 		 741 aa  72  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  35.61 
 
 		 701 aa  70.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  31.08 
 
 		 736 aa  70.5  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  34.85 
 
 		 702 aa  69.7  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  34.85 
 
 		 703 aa  69.7  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  28.41 
 
 		 709 aa  69.3  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  29.95 
 
 		 697 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  32.14 
 
 		 707 aa  68.2  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  31.62 
 
 		 714 aa  67.4  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  24.07 
 
 		 235 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  35 
 
 		 698 aa  67  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  30.99 
 
 		 720 aa  65.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  27.57 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  23.79 
 
 		 721 aa  65.1  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  28.97 
 
 		 699 aa  64.7  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  29.74 
 
 		 688 aa  64.7  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  33.59 
 
 		 701 aa  64.7  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  24.46 
 
 		 715 aa  64.3  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  30.43 
 
 		 696 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  29.13 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  24.76 
 
 		 714 aa  62.4  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  28.4 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  29.71 
 
 		 720 aa  60.8  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  27.18 
 
 		 1177 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  24.92 
 
 		 715 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  24.58 
 
 		 701 aa  58.9  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  29.05 
 
 		 715 aa  58.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  32.56 
 
 		 709 aa  58.9  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  25.59 
 
 		 715 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  29.44 
 
 		 367 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  23.76 
 
 		 1124 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 948 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  26.83 
 
 		 350 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  25.42 
 
 		 1171 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0630  lipoprotein (VmcF)  31.2 
 
 		 176 aa  45.8  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0251425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  28.87 
 
 		 238 aa  45.8  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  33.08 
 
 		 2821 aa  44.3  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  21.93 
 
 		 711 aa  44.3  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>