58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0147 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  100 
 
 		 698 aa  1385    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  71.98 
 
 		 697 aa  957    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  60.83 
 
 		 701 aa  826    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  63.18 
 
 		 707 aa  873    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  60.37 
 
 		 701 aa  824    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  60.03 
 
 		 702 aa  837    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  39.63 
 
 		 709 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  39.86 
 
 		 709 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  39.43 
 
 		 714 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  40.33 
 
 		 709 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  39.63 
 
 		 701 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  37.38 
 
 		 719 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  35.79 
 
 		 688 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  34.14 
 
 		 703 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  36.31 
 
 		 720 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  40.73 
 
 		 474 aa  366  1e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  36.07 
 
 		 696 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  35.88 
 
 		 699 aa  358  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  28.04 
 
 		 720 aa  192  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  27.21 
 
 		 715 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  27.62 
 
 		 741 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  27.43 
 
 		 714 aa  170  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  25.76 
 
 		 711 aa  150  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  26.4 
 
 		 715 aa  147  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  25.64 
 
 		 715 aa  145  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  26.06 
 
 		 715 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  27.03 
 
 		 721 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  25.87 
 
 		 736 aa  113  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  25.24 
 
 		 720 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  27.12 
 
 		 367 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  30.36 
 
 		 1171 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  30.15 
 
 		 1177 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  25.83 
 
 		 1124 aa  83.2  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  25.6 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  22.3 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  36.09 
 
 		 825 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0373  hypothetical protein  27.87 
 
 		 205 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.5146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  34.29 
 
 		 838 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  29.85 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  35 
 
 		 847 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  35 
 
 		 847 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  35 
 
 		 844 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  28.48 
 
 		 948 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  31.72 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  33.9 
 
 		 824 aa  63.9  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  29.68 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  35 
 
 		 812 aa  57.4  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  31.85 
 
 		 497 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  26.22 
 
 		 761 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1951  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1097 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00270024  hitchhiker  0.000836755 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  27.74 
 
 		 176 aa  48.5  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.16 
 
 		 351 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  31.4 
 
 		 299 aa  45.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  36.21 
 
 		 235 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4731  secretion protein HlyD family protein  30.52 
 
 		 239 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3230  sterol-regulatory element binding protein  22.12 
 
 		 171 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3826  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.89 
 
 		 315 aa  43.9  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>