48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2919 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  69.5 
 
 
812 aa  972    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  50.42 
 
 
844 aa  735    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  49.69 
 
 
825 aa  736    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  52.92 
 
 
838 aa  713    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  50.42 
 
 
847 aa  734    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  100 
 
 
824 aa  1629    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  50.42 
 
 
847 aa  734    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  40.7 
 
 
761 aa  248  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  35.84 
 
 
497 aa  245  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  25.6 
 
 
413 aa  107  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  32.39 
 
 
736 aa  82.4  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  28.23 
 
 
696 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  28.22 
 
 
719 aa  70.5  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  25.58 
 
 
235 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  30.06 
 
 
702 aa  68.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  30.06 
 
 
701 aa  68.2  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  24.36 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  27.37 
 
 
707 aa  67  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  30.48 
 
 
709 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  27.92 
 
 
703 aa  65.1  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  26.06 
 
 
741 aa  64.3  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  33.9 
 
 
698 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  33.33 
 
 
697 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  33.08 
 
 
701 aa  63.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  27.37 
 
 
714 aa  60.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  23.08 
 
 
688 aa  60.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  26.85 
 
 
715 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  27.27 
 
 
367 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  28.77 
 
 
1177 aa  58.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  30.1 
 
 
709 aa  58.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  25.27 
 
 
699 aa  58.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  23.93 
 
 
709 aa  58.2  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  27.4 
 
 
715 aa  58.2  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  26.94 
 
 
715 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  26.42 
 
 
720 aa  56.6  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  28.93 
 
 
701 aa  55.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  27.01 
 
 
714 aa  55.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  27.39 
 
 
715 aa  55.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  26.81 
 
 
720 aa  55.1  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  30.28 
 
 
720 aa  54.7  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  26.83 
 
 
721 aa  54.3  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  26.76 
 
 
1171 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 
1124 aa  48.9  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  29.71 
 
 
398 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  48.5  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  28.57 
 
 
711 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  23.44 
 
 
350 aa  47  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  28.86 
 
 
948 aa  45.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>