More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4731 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4731  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 239 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  65.78 
 
 		 316 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  57.39 
 
 		 293 aa  264  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.22 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  56.22 
 
 		 288 aa  261  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  55.36 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.5 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  55.79 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.51 
 
 		 316 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  51.28 
 
 		 304 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  56.22 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  52.36 
 
 		 288 aa  238  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  51.46 
 
 		 315 aa  236  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  55.86 
 
 		 291 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  44.26 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  48.75 
 
 		 302 aa  205  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  49.14 
 
 		 305 aa  203  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  46.86 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  45.78 
 
 		 337 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  46.29 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  44.44 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  47.9 
 
 		 327 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  47.03 
 
 		 302 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  42.67 
 
 		 291 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  42.67 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  43.11 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  46.58 
 
 		 302 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  48.21 
 
 		 289 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  48.21 
 
 		 289 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  42.67 
 
 		 291 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  43.75 
 
 		 324 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  43.75 
 
 		 324 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0109  FusE-MFP/HlyD family membrane protein  48.43 
 
 		 299 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  44.64 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  46.67 
 
 		 299 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  47.77 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  42.04 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  43.42 
 
 		 297 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  41.78 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  46.04 
 
 		 323 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.89 
 
 		 336 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  44.64 
 
 		 324 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  43.56 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.05 
 
 		 344 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  43.48 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  44.64 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  44.64 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  45.26 
 
 		 328 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  43.5 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3499  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  42.79 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  42.79 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  44.84 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  46.64 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  40.69 
 
 		 287 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  40.69 
 
 		 287 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  43.2 
 
 		 314 aa  174  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  40.85 
 
 		 286 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  40.85 
 
 		 286 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  40.6 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  40.26 
 
 		 287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  40.43 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  40.26 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  41.45 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  51.77 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  40.6 
 
 		 286 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  37.77 
 
 		 310 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  42.03 
 
 		 351 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.371708 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.77 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  37.77 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  37.34 
 
 		 310 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  37.34 
 
 		 310 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  37.34 
 
 		 310 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  37.34 
 
 		 310 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  37.34 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  42.79 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  37.34 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  46.86 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  44.16 
 
 		 293 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  44.16 
 
 		 293 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3628  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  37.34 
 
 		 310 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0802422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3725  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  37.34 
 
 		 310 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0948843 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3663  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  37.34 
 
 		 310 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  42.08 
 
 		 294 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0932  hypothetical protein  44.16 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0746  hypothetical protein  44.16 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3678  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  38.2 
 
 		 310 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3826  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.46 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  44.16 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0416  hypothetical protein  44.16 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87523  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0484  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  39.48 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1176  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  39.48 
 
 		 311 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  41.36 
 
 		 287 aa  164  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  41.09 
 
 		 294 aa  164  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2628  HlyD family secretion protein  43.86 
 
 		 291 aa  164  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0263  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  37.66 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  43 
 
 		 359 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  40.85 
 
 		 289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1851  FusE  44.3 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4391  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  36.48 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>