More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0263 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0263  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  100 
 
 		 321 aa  655    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0272  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  91.59 
 
 		 321 aa  608  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3826  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  75 
 
 		 315 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3628  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  69.71 
 
 		 310 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0802422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3725  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  69.71 
 
 		 310 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0948843 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3663  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  69.71 
 
 		 310 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  68.4 
 
 		 310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  68.08 
 
 		 310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  68.08 
 
 		 310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  69.38 
 
 		 310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  68.4 
 
 		 310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  68.4 
 
 		 310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  68.4 
 
 		 310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  69.38 
 
 		 310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  68.08 
 
 		 310 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4391  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  69.84 
 
 		 311 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1176  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  71.8 
 
 		 311 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539162 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3678  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  68.08 
 
 		 310 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0484  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  72.08 
 
 		 311 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4558  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  68.08 
 
 		 309 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0420  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  70.49 
 
 		 311 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3668  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  71.1 
 
 		 315 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  40.99 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  42.05 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  41.3 
 
 		 314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  42.55 
 
 		 289 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  40.07 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  39.26 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  42.32 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  38.97 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  40.43 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  38.97 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  37.37 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  41.13 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  38.28 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  40.73 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  39.22 
 
 		 288 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  39.22 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  37.83 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  38.11 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  39.43 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  39.08 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  39.08 
 
 		 291 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  39.08 
 
 		 291 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  40.91 
 
 		 293 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  41.34 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  37.45 
 
 		 287 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  37.99 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  37 
 
 		 285 aa  196  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  39.93 
 
 		 304 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  37 
 
 		 285 aa  196  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  37 
 
 		 285 aa  196  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  39.22 
 
 		 288 aa  195  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  37 
 
 		 285 aa  195  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  36.63 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 358 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.63 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  37.08 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  36.26 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.98 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  36.63 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  36.63 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  36.7 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  38.49 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  40.28 
 
 		 317 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.63 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  40.61 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  39.52 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  41.45 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  39.35 
 
 		 327 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  37.63 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  38.71 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  40.23 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  41.7 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4754  secretion protein HlyD family protein  41.47 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0178648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  39.71 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21290  hypothetical protein  43.98 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.13 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  37.96 
 
 		 285 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  40.36 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  40.73 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  40.36 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.55 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  39.38 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1821  hypothetical protein  43.61 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  39.44 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.74 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  37.93 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  37.37 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  39.08 
 
 		 286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  39.46 
 
 		 323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  39.33 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  38.75 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  38.08 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  37.85 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  38.08 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  37.89 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>