More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0869 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 311 aa  608  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  67.12 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  51.69 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  54.06 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  52.04 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  52.04 
 
 		 291 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  54.39 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  51.7 
 
 		 291 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  49.16 
 
 		 295 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  52.4 
 
 		 324 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  52.4 
 
 		 324 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.51 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  54.64 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  50.71 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.74 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  55.28 
 
 		 316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  52.23 
 
 		 324 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  53.74 
 
 		 328 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  61 
 
 		 294 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.06 
 
 		 336 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  53.79 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  55.86 
 
 		 323 aa  275  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  49.16 
 
 		 304 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  51.07 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  51.42 
 
 		 288 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  53.9 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  50.57 
 
 		 294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.77 
 
 		 316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  53.41 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  46.74 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  57.36 
 
 		 317 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  50.97 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  51.43 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  51.43 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  49.1 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  50.71 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  51.22 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  52.96 
 
 		 305 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  51.97 
 
 		 297 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  44.48 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  44.13 
 
 		 287 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  44.13 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  50.9 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  49.3 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  46.95 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  43.77 
 
 		 287 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  48.06 
 
 		 289 aa  251  8.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  50.71 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0109  FusE-MFP/HlyD family membrane protein  52.14 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  51.32 
 
 		 287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3499  secretion protein HlyD family protein  46.38 
 
 		 325 aa  241  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  46.4 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  49.83 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  47.9 
 
 		 286 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  48.4 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  48.04 
 
 		 302 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  47.86 
 
 		 286 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  47.55 
 
 		 286 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  47.86 
 
 		 286 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  49.29 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  51.27 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  51.09 
 
 		 291 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  51.62 
 
 		 286 aa  235  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  47.69 
 
 		 302 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  48.56 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  48.56 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  49.03 
 
 		 314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  43.32 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  43.93 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  49.64 
 
 		 292 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  49.64 
 
 		 292 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  48.75 
 
 		 289 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  48.93 
 
 		 291 aa  228  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  46.39 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  43.67 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2628  HlyD family secretion protein  51.07 
 
 		 291 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  50.71 
 
 		 293 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  50.71 
 
 		 293 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0932  hypothetical protein  50.71 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  50.71 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0416  hypothetical protein  50.71 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0746  hypothetical protein  50.71 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1851  FusE  50.36 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4096  secretion protein HlyD  49.45 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413596  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  41.78 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  47.25 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1399  secretion protein HlyD family protein  46.39 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  47.75 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3678  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  42.07 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  44.81 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1869  secretion protein HlyD family protein  49.29 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  41.13 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1176  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.16 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0484  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.16 
 
 		 311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1954  secretion protein HlyD  46.05 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  40.21 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  40.21 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  40.21 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  40.21 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  39.86 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>