More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5690 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 293 aa  589  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.92 
 
 		 315 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  54.01 
 
 		 316 aa  311  9e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  52.08 
 
 		 315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  51.59 
 
 		 288 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.96 
 
 		 314 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  52.52 
 
 		 288 aa  291  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  51.59 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  50.17 
 
 		 308 aa  289  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 291 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.56 
 
 		 316 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4731  secretion protein HlyD family protein  57.64 
 
 		 239 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  47.55 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  51.25 
 
 		 317 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  45.12 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  46.26 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  45.91 
 
 		 291 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  45.91 
 
 		 291 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  45.55 
 
 		 291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  44.6 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  42.96 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  45.8 
 
 		 299 aa  248  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  47.69 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  42.71 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  43.93 
 
 		 337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  45.04 
 
 		 328 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  45.42 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  44.88 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  45.82 
 
 		 305 aa  239  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0109  FusE-MFP/HlyD family membrane protein  46.5 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  45.58 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  45.58 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  45.13 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  45.58 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.75 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4096  secretion protein HlyD  47.83 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413596  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  43.21 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  46.21 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  43.51 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  42.5 
 
 		 324 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  42.5 
 
 		 324 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  42.66 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  42.61 
 
 		 286 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  42.61 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  42.76 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  42.14 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  43.43 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  46.92 
 
 		 294 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  42.32 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  41.55 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  42.32 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  44.4 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  45.39 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  41.32 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  41.92 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  40.97 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  45.3 
 
 		 292 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  41.22 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  42.2 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  45.83 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  43.68 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.49 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.49 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  42.14 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  41.84 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.84 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  41.84 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3499  secretion protein HlyD family protein  41.04 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  43.97 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.68 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.84 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  39.44 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  43.89 
 
 		 287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  42.27 
 
 		 289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  43.58 
 
 		 314 aa  214  9e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.55 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.55 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1176  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.88 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539162 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3663  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.55 
 
 		 310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3628  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.55 
 
 		 310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0802422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3725  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.55 
 
 		 310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0948843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  37.96 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0263  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.91 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  38.52 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0484  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.88 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  38.52 
 
 		 287 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  46.4 
 
 		 311 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  41.99 
 
 		 304 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  38.52 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4558  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.49 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  37.81 
 
 		 287 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0272  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.42 
 
 		 321 aa  208  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  41.03 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  40.97 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  40.97 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  42.18 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1399  secretion protein HlyD family protein  38.57 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  42.18 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0420  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.43 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  42.18 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>