More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4009 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 305 aa  604  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  57.3 
 
 		 291 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  57.65 
 
 		 291 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  57.3 
 
 		 291 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  57.3 
 
 		 291 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  58.48 
 
 		 322 aa  324  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  56.84 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  55.78 
 
 		 324 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  57.04 
 
 		 324 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  56.73 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  56.73 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  58.49 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.89 
 
 		 336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  60 
 
 		 323 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  56.13 
 
 		 324 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  57.81 
 
 		 294 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  57.03 
 
 		 294 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  55.14 
 
 		 328 aa  298  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  60 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  51.66 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.79 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.16 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  50.72 
 
 		 299 aa  266  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  52.65 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  51.24 
 
 		 299 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  49.46 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  45.8 
 
 		 288 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.96 
 
 		 316 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  45.21 
 
 		 288 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  48.46 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4096  secretion protein HlyD  47.93 
 
 		 270 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413596  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0109  FusE-MFP/HlyD family membrane protein  50.35 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  46.72 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  49.27 
 
 		 304 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  47.26 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  45.39 
 
 		 314 aa  242  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3499  secretion protein HlyD family protein  44.19 
 
 		 325 aa  241  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  51.55 
 
 		 317 aa  241  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  48.94 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  47 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  47 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  42.05 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  47.64 
 
 		 288 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  47 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  41.79 
 
 		 285 aa  232  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  41.43 
 
 		 285 aa  231  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.43 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  41.43 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  46.55 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  41.43 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 285 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  52.96 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 285 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  41.43 
 
 		 285 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  46.02 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  46.62 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  41.07 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  49.46 
 
 		 304 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  44.33 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  47.52 
 
 		 284 aa  225  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  40.35 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  50.58 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.25 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  45.58 
 
 		 286 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  45.23 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  48.76 
 
 		 286 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  46.88 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  46.88 
 
 		 302 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  44.8 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.22 
 
 		 310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.22 
 
 		 310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  41.22 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  41.22 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.22 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.22 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  43.71 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.88 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  42.64 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  43.82 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  43.82 
 
 		 286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3678  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.07 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  41.41 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  41.41 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  45.76 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  48.06 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  41.41 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  41.41 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  41.58 
 
 		 285 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0272  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.98 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3628  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.1 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0802422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3663  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.1 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  41.41 
 
 		 286 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3725  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.1 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0948843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0263  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  42.32 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  44.44 
 
 		 291 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4558  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.88 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  45.42 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  45.42 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.75 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.75 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>