More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7724 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  100 
 
 
324 aa  646    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  91.98 
 
 
324 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  89.23 
 
 
322 aa  567  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  95.24 
 
 
324 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  93.94 
 
 
331 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  90.48 
 
 
323 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  81.53 
 
 
334 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  79.72 
 
 
337 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  82.58 
 
 
336 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  68.06 
 
 
291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  68.06 
 
 
291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  67.71 
 
 
291 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  67.36 
 
 
291 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  66.32 
 
 
295 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  64.21 
 
 
294 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  64.21 
 
 
294 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  56.71 
 
 
328 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  63.2 
 
 
294 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  52.02 
 
 
305 aa  305  7e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  47.55 
 
 
288 aa  273  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  50.18 
 
 
316 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.18 
 
 
315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  47.55 
 
 
288 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.05 
 
 
316 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  54.65 
 
 
317 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  46.5 
 
 
288 aa  258  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  47.87 
 
 
299 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  45.49 
 
 
315 aa  255  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  49.47 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.07 
 
 
314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  45.76 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  48.24 
 
 
291 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  47.06 
 
 
308 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0109  FusE-MFP/HlyD family membrane protein  49.12 
 
 
299 aa  245  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4096  secretion protein HlyD  47.12 
 
 
270 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413596  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3499  secretion protein HlyD family protein  47.84 
 
 
325 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  46.76 
 
 
304 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  52.23 
 
 
311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  45.77 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  43.27 
 
 
285 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  45.05 
 
 
297 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  45.02 
 
 
314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.39 
 
 
285 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  41.03 
 
 
285 aa  225  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  41.39 
 
 
285 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  41.39 
 
 
285 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  41.39 
 
 
285 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  40.66 
 
 
285 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  41.39 
 
 
285 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  41.39 
 
 
285 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  46.88 
 
 
294 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  41.03 
 
 
285 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  45.7 
 
 
286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  45.36 
 
 
286 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 
287 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 
287 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 
287 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 
287 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  42.97 
 
 
293 aa  215  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  45.48 
 
 
302 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  43.94 
 
 
286 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  44.8 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  43.49 
 
 
286 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  44.8 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  43.94 
 
 
286 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  46.64 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 
289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  41.84 
 
 
289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  40.61 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  42.61 
 
 
297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  40.07 
 
 
288 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  43.25 
 
 
304 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48350  hypothetical protein  45.42 
 
 
302 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707172  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  41.63 
 
 
286 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  41.63 
 
 
286 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  41.63 
 
 
286 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  41.63 
 
 
286 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.11 
 
 
344 aa  209  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 
300 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.12 
 
 
358 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  41.63 
 
 
286 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  42.91 
 
 
359 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4754  secretion protein HlyD family protein  43.7 
 
 
359 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0178648  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  41.2 
 
 
288 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4391  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  37.37 
 
 
311 aa  202  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  40.49 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  40.49 
 
 
289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  44.64 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1954  secretion protein HlyD  41.88 
 
 
300 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1399  secretion protein HlyD family protein  42.64 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  45.99 
 
 
286 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  44.94 
 
 
287 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  45.59 
 
 
292 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  42.86 
 
 
310 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  42.86 
 
 
310 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3628  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  42.86 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0802422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3725  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  42.86 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0948843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  40.28 
 
 
284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3663  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  42.86 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  40.95 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>