More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3620 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 294 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  95.58 
 
 		 294 aa  540  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  84.72 
 
 		 295 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  82.93 
 
 		 291 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  82.93 
 
 		 291 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  83.28 
 
 		 291 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  82.58 
 
 		 291 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  67.6 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  66.67 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  64.21 
 
 		 324 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  63.45 
 
 		 322 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  66.55 
 
 		 336 aa  374  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  64.21 
 
 		 324 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  63.23 
 
 		 331 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  64.21 
 
 		 324 aa  364  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  64.07 
 
 		 323 aa  359  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  56.36 
 
 		 328 aa  311  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  61.96 
 
 		 294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  54.04 
 
 		 305 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  45.49 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.74 
 
 		 315 aa  262  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  49.3 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  45.49 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.88 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  48.25 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.39 
 
 		 316 aa  251  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4096  secretion protein HlyD  46.67 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413596  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  44.79 
 
 		 288 aa  248  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  45.64 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  46.24 
 
 		 299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  44.86 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  44.98 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  48.83 
 
 		 317 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  44 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3499  secretion protein HlyD family protein  42.17 
 
 		 325 aa  238  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  43.36 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  48.98 
 
 		 311 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0109  FusE-MFP/HlyD family membrane protein  44.56 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  43.51 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  46.29 
 
 		 303 aa  228  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  46.29 
 
 		 303 aa  228  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  42.42 
 
 		 314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  42.66 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  41.84 
 
 		 289 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  40.69 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  45.07 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  40.99 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  44.25 
 
 		 300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  42.14 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  43.51 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  37.37 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  42.24 
 
 		 289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  42.03 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  41.79 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.91 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.91 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3663  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.91 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3628  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.91 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0802422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3725  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.91 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0948843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  36.65 
 
 		 287 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  36.65 
 
 		 287 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  38.46 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  36.3 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1954  secretion protein HlyD  41.38 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.79 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 		 285 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 		 285 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  38.46 
 
 		 285 aa  206  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.21 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.1 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  38.1 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  39.43 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  38.1 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  38.1 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  39.86 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3678  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.56 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  39.86 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  39.86 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  37.73 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  39.86 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.51 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  39.51 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  40.58 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  40.58 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  41.76 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  37.73 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  39.19 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0272  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  39.78 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  39.78 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4558  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  39.51 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  39.19 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0263  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.07 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48350  hypothetical protein  41.18 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707172  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  37.93 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  41.6 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  39.69 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  39.69 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  39.69 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  39.69 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>