More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1291 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  56.18 
 
 
287 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  55.48 
 
 
287 aa  348  5e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  55.48 
 
 
287 aa  348  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  55.12 
 
 
287 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  53.71 
 
 
289 aa  308  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  47.02 
 
 
288 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  47.69 
 
 
284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  48.42 
 
 
289 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  48.42 
 
 
289 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  47.72 
 
 
288 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  41.7 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  42.55 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.84 
 
 
315 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  43.68 
 
 
302 aa  232  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  42.4 
 
 
285 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  42.16 
 
 
315 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  43.26 
 
 
286 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  42.91 
 
 
286 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.79 
 
 
314 aa  225  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21290  hypothetical protein  49.43 
 
 
285 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1821  hypothetical protein  49.43 
 
 
285 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  41.01 
 
 
308 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  39.01 
 
 
297 aa  222  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  42.05 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  42.05 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  42.05 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  41.7 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  41.7 
 
 
285 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  41.7 
 
 
285 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  41.34 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.34 
 
 
285 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  41.34 
 
 
285 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  40.57 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  40.57 
 
 
286 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  42.24 
 
 
291 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  40.21 
 
 
286 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  41.99 
 
 
314 aa  212  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  41.54 
 
 
317 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  43.2 
 
 
327 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  42.55 
 
 
291 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  43.93 
 
 
311 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  42.69 
 
 
286 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  38.19 
 
 
334 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  38.99 
 
 
297 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  42.31 
 
 
286 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 
286 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  42.31 
 
 
286 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  42.7 
 
 
291 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  42.31 
 
 
286 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  42.31 
 
 
286 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  40.57 
 
 
289 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  42.81 
 
 
286 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  37.37 
 
 
288 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  42.65 
 
 
292 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  38.19 
 
 
334 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  41.99 
 
 
292 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  41.58 
 
 
305 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  41.99 
 
 
292 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  39.84 
 
 
294 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.86 
 
 
316 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  38.6 
 
 
304 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  38.87 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  38.87 
 
 
302 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  39.78 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  39.78 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  39.22 
 
 
295 aa  198  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3499  secretion protein HlyD family protein  38.19 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  37.5 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  37.37 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  38.87 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  38.16 
 
 
291 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  38.16 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  39.06 
 
 
294 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  38.16 
 
 
291 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  38.4 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  37.81 
 
 
291 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  40.35 
 
 
287 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  38.27 
 
 
324 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  38.55 
 
 
322 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  38.27 
 
 
324 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2628  HlyD family secretion protein  42.35 
 
 
291 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  37.82 
 
 
300 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1851  FusE  41.64 
 
 
291 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  39.21 
 
 
337 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1424  secretion protein HlyD family protein  42.7 
 
 
291 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0964  secretion protein HlyD  42.7 
 
 
291 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000197103  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1446  secretion protein HlyD family protein  42.7 
 
 
291 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  41.28 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0746  hypothetical protein  41.28 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0932  hypothetical protein  41.28 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  41.28 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  41.28 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0416  hypothetical protein  41.28 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4391  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  37.46 
 
 
311 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  39.15 
 
 
359 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  37.68 
 
 
310 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.5 
 
 
358 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  38.08 
 
 
299 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  36.52 
 
 
351 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.371708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>