More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3168 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 299 aa  587  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0109  FusE-MFP/HlyD family membrane protein  68.94 
 
 		 299 aa  387  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.23 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  50.18 
 
 		 337 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  48.75 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  48.75 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  48.75 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  48.75 
 
 		 291 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  51.09 
 
 		 334 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  53.05 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  48.3 
 
 		 324 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  49.82 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  52.49 
 
 		 323 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  48.3 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  48.64 
 
 		 322 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  46.24 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  50.18 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  51.15 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.92 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  51.24 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  44.04 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  47.83 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.12 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  48.99 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  52.27 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50 
 
 		 336 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  49.13 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  48.05 
 
 		 294 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  55.04 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  48.05 
 
 		 294 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  47.83 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  46.95 
 
 		 293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  50.95 
 
 		 328 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  48.66 
 
 		 288 aa  242  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  45.27 
 
 		 299 aa  241  9e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  48.74 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  47.86 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  46.59 
 
 		 289 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  46.59 
 
 		 289 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  43.88 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  45.52 
 
 		 286 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  46.67 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  45.16 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  46.67 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  45.23 
 
 		 288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  46.29 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  43.48 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.05 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  44.07 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3499  secretion protein HlyD family protein  43.59 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  44.06 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  40.7 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.7 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.7 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  40.7 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.35 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.35 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  44.4 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  44.04 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  44.04 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  46.32 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  50.71 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  42.01 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  45.23 
 
 		 289 aa  208  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.56 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.56 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3725  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.56 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0948843 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3663  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.56 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3628  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.56 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0802422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  44.13 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4558  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40.35 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  42.66 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4096  secretion protein HlyD  45.02 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0272  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  42.14 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  38.3 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3678  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  39.25 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  43.9 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  43.9 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  43.34 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0263  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.13 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  45.77 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.41 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  43.55 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  43.55 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.87 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  38.24 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  46.29 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  37.87 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4391  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  39.08 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  37.87 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  37.87 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  37.87 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  37.87 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  37.87 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1176  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40 
 
 		 311 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539162 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  46.29 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  46.55 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3826  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  42.97 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  37.5 
 
 		 285 aa  192  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0484  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  40 
 
 		 311 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>