More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0109 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0109  FusE-MFP/HlyD family membrane protein  100 
 
 
299 aa  591  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  68.94 
 
 
299 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  52.26 
 
 
291 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.17 
 
 
315 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  51.59 
 
 
316 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  49.3 
 
 
288 aa  266  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.96 
 
 
314 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  48.07 
 
 
334 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  49.13 
 
 
322 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  51.95 
 
 
323 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  48.07 
 
 
337 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  46.69 
 
 
291 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  48.43 
 
 
324 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  46.29 
 
 
291 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  48.43 
 
 
324 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  49.3 
 
 
288 aa  259  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  51.57 
 
 
324 aa  258  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  46.34 
 
 
291 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  46.34 
 
 
291 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  51.57 
 
 
331 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  50.19 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.08 
 
 
316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  46.05 
 
 
315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  50.7 
 
 
304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  44.52 
 
 
295 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.18 
 
 
336 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  50.35 
 
 
305 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  48.64 
 
 
308 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  47.57 
 
 
293 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  52.92 
 
 
294 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  51.77 
 
 
294 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  51.34 
 
 
317 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  48.93 
 
 
302 aa  246  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  46.15 
 
 
294 aa  245  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  46.15 
 
 
294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  46.25 
 
 
327 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  43.51 
 
 
299 aa  231  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3499  secretion protein HlyD family protein  47.21 
 
 
325 aa  230  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  49.62 
 
 
328 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  43.26 
 
 
288 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  45.45 
 
 
297 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 
289 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 
289 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  45.58 
 
 
297 aa  221  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  45.23 
 
 
286 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  44.88 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  47.74 
 
 
302 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  43.17 
 
 
288 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  44.87 
 
 
314 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  47.37 
 
 
302 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  48.58 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  49.11 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  43.94 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  42.76 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  52.14 
 
 
311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  50.74 
 
 
286 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  42.4 
 
 
286 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  42.4 
 
 
286 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  42.96 
 
 
289 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  42.45 
 
 
289 aa  208  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4096  secretion protein HlyD  43.42 
 
 
270 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  42.5 
 
 
284 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  45.17 
 
 
300 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  45.88 
 
 
291 aa  205  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  46.24 
 
 
292 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  46.24 
 
 
292 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.9 
 
 
310 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.96 
 
 
358 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  41.55 
 
 
310 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  41.55 
 
 
310 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.55 
 
 
310 aa  202  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.55 
 
 
310 aa  202  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.2 
 
 
310 aa  202  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.2 
 
 
310 aa  202  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  38.73 
 
 
285 aa  201  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.05 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4731  secretion protein HlyD family protein  50.73 
 
 
239 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  45.45 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.05 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  45.45 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3663  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.05 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3628  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.05 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0802422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3725  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.05 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0948843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  45.14 
 
 
287 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1851  FusE  46.48 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  42.05 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  43.97 
 
 
359 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4754  secretion protein HlyD family protein  44.14 
 
 
359 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0178648  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.7 
 
 
344 aa  196  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1954  secretion protein HlyD  42.18 
 
 
300 aa  195  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4558  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.2 
 
 
309 aa  195  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2628  HlyD family secretion protein  46.48 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3678  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.88 
 
 
310 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  46.13 
 
 
293 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  46.13 
 
 
293 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0932  hypothetical protein  46.13 
 
 
293 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0416  hypothetical protein  46.13 
 
 
293 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0746  hypothetical protein  46.13 
 
 
293 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  46.13 
 
 
293 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  44.11 
 
 
334 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>