More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0941 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  100 
 
 		 287 aa  586  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  86.52 
 
 		 286 aa  510  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  86.52 
 
 		 286 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  84.75 
 
 		 286 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  84.75 
 
 		 286 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  84.04 
 
 		 286 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  83.69 
 
 		 289 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  79.08 
 
 		 302 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  79.08 
 
 		 302 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  68.57 
 
 		 297 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  69.4 
 
 		 286 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  69.04 
 
 		 291 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  69.04 
 
 		 292 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2628  HlyD family secretion protein  69.01 
 
 		 291 aa  359  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0932  hypothetical protein  68.31 
 
 		 293 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0746  hypothetical protein  68.31 
 
 		 293 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  68.31 
 
 		 293 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0416  hypothetical protein  68.31 
 
 		 293 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87523  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  67.96 
 
 		 293 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  67.96 
 
 		 293 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1851  FusE  67.96 
 
 		 291 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  66.55 
 
 		 292 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  66.55 
 
 		 292 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  65.85 
 
 		 291 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1869  secretion protein HlyD family protein  67.25 
 
 		 292 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0964  secretion protein HlyD  66.2 
 
 		 291 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000197103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1424  secretion protein HlyD family protein  66.2 
 
 		 291 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1446  secretion protein HlyD family protein  66.2 
 
 		 291 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  58.66 
 
 		 299 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  56.54 
 
 		 297 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  53.74 
 
 		 302 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  48.79 
 
 		 288 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  50.55 
 
 		 284 aa  270  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 289 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  49.82 
 
 		 289 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  49.12 
 
 		 288 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  48.06 
 
 		 316 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  45.8 
 
 		 289 aa  254  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.81 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  46.45 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  46.45 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  45.42 
 
 		 285 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  44.29 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  45.99 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1821  hypothetical protein  52.29 
 
 		 285 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  46.07 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  48.65 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  48.08 
 
 		 304 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1399  secretion protein HlyD family protein  48.85 
 
 		 302 aa  241  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21290  hypothetical protein  51.91 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.45 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.79 
 
 		 314 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  41.26 
 
 		 288 aa  236  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  47.1 
 
 		 359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.26 
 
 		 358 aa  235  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  43.36 
 
 		 288 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  48.2 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  44.72 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  44.72 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  44.72 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  44.72 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  41.46 
 
 		 287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  44.37 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.37 
 
 		 285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  44.37 
 
 		 285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4754  secretion protein HlyD family protein  46.9 
 
 		 359 aa  232  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0178648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  44.01 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.99 
 
 		 344 aa  232  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  44.37 
 
 		 285 aa  232  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  41.11 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  41.11 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  41.11 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  42.51 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  41.61 
 
 		 288 aa  229  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  43.55 
 
 		 334 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  45.55 
 
 		 327 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  45.14 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  43.4 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  45.26 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  43.63 
 
 		 326 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1542  secretion protein HlyD family protein  45.42 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  46.15 
 
 		 314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  42.66 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  42.27 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  40.14 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  40.35 
 
 		 285 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  42.16 
 
 		 334 aa  218  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  42.6 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4156  hypothetical protein  45.8 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  43.79 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1954  secretion protein HlyD  44.72 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  43.4 
 
 		 324 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  45.39 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  43.4 
 
 		 324 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  43.31 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  43.31 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  43.31 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  43.31 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  42.96 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>