More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1186 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
289 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  99.31 
 
 
289 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  95.82 
 
 
288 aa  534  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  90.85 
 
 
288 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  69.72 
 
 
284 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1821  hypothetical protein  69.61 
 
 
285 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  57.09 
 
 
289 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21290  hypothetical protein  69.61 
 
 
285 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  51.97 
 
 
297 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  48.42 
 
 
285 aa  278  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  49.82 
 
 
302 aa  276  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  50.36 
 
 
315 aa  275  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  49.64 
 
 
299 aa  272  6e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  52.16 
 
 
291 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  51.42 
 
 
316 aa  268  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  45.23 
 
 
287 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  47.52 
 
 
286 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  48.42 
 
 
286 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  47.52 
 
 
286 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  48.42 
 
 
286 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  47.52 
 
 
286 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  44.88 
 
 
287 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  44.88 
 
 
287 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  44.52 
 
 
287 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.07 
 
 
315 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  46.45 
 
 
289 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  50 
 
 
302 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  49.64 
 
 
302 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  49.83 
 
 
327 aa  255  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  46.29 
 
 
297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.06 
 
 
314 aa  252  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.12 
 
 
316 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  45.13 
 
 
288 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  50.57 
 
 
287 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  45.49 
 
 
288 aa  246  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  48.23 
 
 
286 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  48.76 
 
 
292 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  51.35 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  48.06 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  52.33 
 
 
311 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  45 
 
 
285 aa  242  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  45 
 
 
285 aa  242  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  45 
 
 
285 aa  242  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  48.57 
 
 
292 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  48.57 
 
 
292 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  43.82 
 
 
291 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 
291 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  43.82 
 
 
291 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  43.82 
 
 
291 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  44.64 
 
 
285 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  48.57 
 
 
291 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  44.64 
 
 
285 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  48.74 
 
 
308 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.416269 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.29 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  44.29 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  44.29 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  45.39 
 
 
303 aa  239  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  43.93 
 
 
285 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  45.39 
 
 
303 aa  239  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  45.49 
 
 
288 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  42.14 
 
 
285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  44.4 
 
 
295 aa  235  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.61 
 
 
358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1851  FusE  48.23 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  46.83 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1869  secretion protein HlyD family protein  48.44 
 
 
292 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  44.24 
 
 
314 aa  232  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  47 
 
 
305 aa  232  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  45.82 
 
 
300 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  45.11 
 
 
359 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  46.04 
 
 
293 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  44.15 
 
 
351 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2628  HlyD family secretion protein  47.52 
 
 
291 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  47.52 
 
 
293 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  47.52 
 
 
293 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0964  secretion protein HlyD  48.57 
 
 
291 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000197103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1424  secretion protein HlyD family protein  48.57 
 
 
291 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1446  secretion protein HlyD family protein  48.57 
 
 
291 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  47.52 
 
 
293 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0932  hypothetical protein  47.52 
 
 
293 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0416  hypothetical protein  47.52 
 
 
293 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87523  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4754  secretion protein HlyD family protein  44.91 
 
 
359 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0178648  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  45.65 
 
 
328 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0746  hypothetical protein  47.52 
 
 
293 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  45.52 
 
 
334 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.99 
 
 
344 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  45.05 
 
 
334 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1954  secretion protein HlyD  45.85 
 
 
300 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  42.86 
 
 
337 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  43.01 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  46.18 
 
 
294 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  46.59 
 
 
299 aa  221  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  41.79 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0109  FusE-MFP/HlyD family membrane protein  43.73 
 
 
299 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4096  secretion protein HlyD  42.81 
 
 
270 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413596  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  41.84 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1399  secretion protein HlyD family protein  41.7 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  43.3 
 
 
294 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.72 
 
 
310 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  39.72 
 
 
310 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>