More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4791 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  100 
 
 		 328 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  72.03 
 
 		 294 aa  364  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  61.17 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  61.19 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  61.51 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  60.62 
 
 		 322 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  58.22 
 
 		 295 aa  362  6e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  61.19 
 
 		 337 aa  358  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  60.82 
 
 		 324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  60 
 
 		 291 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  59.65 
 
 		 291 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  61.81 
 
 		 331 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  59.3 
 
 		 291 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  59.3 
 
 		 291 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  64.89 
 
 		 323 aa  350  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.19 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  58.24 
 
 		 294 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  57.47 
 
 		 294 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  55.14 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.45 
 
 		 315 aa  292  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.85 
 
 		 314 aa  291  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.59 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  57.41 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  50.35 
 
 		 288 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  48.59 
 
 		 299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4096  secretion protein HlyD  50.87 
 
 		 270 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413596  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  51.05 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  50.35 
 
 		 288 aa  268  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  51.92 
 
 		 288 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  51.24 
 
 		 291 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  50.36 
 
 		 302 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  47.26 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  49.83 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  46.81 
 
 		 304 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  48.94 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  49.82 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  55.76 
 
 		 311 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  45.04 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  48.92 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3499  secretion protein HlyD family protein  45.9 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  47.01 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  46.34 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  44.68 
 
 		 289 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  44.24 
 
 		 288 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  44.84 
 
 		 288 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  45.64 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  45.64 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  44.77 
 
 		 289 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0109  FusE-MFP/HlyD family membrane protein  48.72 
 
 		 299 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  46.32 
 
 		 294 aa  235  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  45.3 
 
 		 286 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  44.79 
 
 		 286 aa  235  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  45.96 
 
 		 286 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  45.96 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  45.55 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  45.55 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  47.58 
 
 		 302 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  48.28 
 
 		 292 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  48.28 
 
 		 292 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  42.86 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  42.86 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  48.26 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  44.16 
 
 		 284 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  47.21 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.49 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  42.49 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  44.6 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  42.49 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  42.49 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  42.12 
 
 		 285 aa  229  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 287 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.75 
 
 		 344 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 287 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  45.53 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 287 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  45.53 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  45.53 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  45.53 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  50.55 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  45.53 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  42.49 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  44.88 
 
 		 289 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  49.3 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  49.09 
 
 		 291 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  42.25 
 
 		 289 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  38.93 
 
 		 287 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2628  HlyD family secretion protein  49.3 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1954  secretion protein HlyD  43.86 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  47.15 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  45.63 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  44.32 
 
 		 351 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4754  secretion protein HlyD family protein  45.8 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0178648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  48.78 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0746  hypothetical protein  48.78 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0932  hypothetical protein  48.78 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  48.78 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  48.78 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>