54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4341 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  100 
 
 
367 aa  738    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  26.93 
 
 
741 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  30.64 
 
 
720 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  32.2 
 
 
474 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  28.31 
 
 
715 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  24.05 
 
 
709 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  26.6 
 
 
703 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  26.45 
 
 
720 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  27.03 
 
 
1124 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  28.44 
 
 
736 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  26.04 
 
 
719 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  26.65 
 
 
1171 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  25.97 
 
 
699 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  25.34 
 
 
696 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  26.38 
 
 
715 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  24.36 
 
 
714 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  26.06 
 
 
715 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  25.14 
 
 
701 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  25.37 
 
 
688 aa  97.8  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  23.51 
 
 
709 aa  96.7  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  27.12 
 
 
698 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  26.21 
 
 
707 aa  93.6  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  28.62 
 
 
1177 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  26.89 
 
 
721 aa  89.7  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  23.28 
 
 
398 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  31.06 
 
 
720 aa  87.8  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  24.18 
 
 
702 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  26.8 
 
 
701 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  23.8 
 
 
709 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  31.1 
 
 
711 aa  83.6  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  24.13 
 
 
715 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  29.85 
 
 
701 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  29.79 
 
 
948 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  22.76 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  31.87 
 
 
714 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  34.91 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  27.67 
 
 
697 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  25.65 
 
 
413 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  25.36 
 
 
756 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  29.47 
 
 
741 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  27.27 
 
 
824 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  29.44 
 
 
844 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  29.44 
 
 
847 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  29.44 
 
 
847 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2431  peptidase M50  29.63 
 
 
410 aa  56.6  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0730109  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  29.47 
 
 
838 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  29.02 
 
 
825 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2586  peptidase M50  26.32 
 
 
398 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0867548  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1951  hypothetical protein  27.72 
 
 
1097 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00270024  hitchhiker  0.000836755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  29.41 
 
 
812 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  29.58 
 
 
497 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  27.5 
 
 
761 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3906  peptidase M50  30.21 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  24.6 
 
 
235 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>