60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1149 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  100 
 
 		 714 aa  1447    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  41.35 
 
 		 709 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  42.19 
 
 		 709 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  40.62 
 
 		 702 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  40.62 
 
 		 701 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  39.94 
 
 		 698 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  39.6 
 
 		 707 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  41.62 
 
 		 697 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  39.72 
 
 		 701 aa  485  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  36.97 
 
 		 719 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  38.53 
 
 		 696 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  38.52 
 
 		 709 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  38.75 
 
 		 699 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  36.72 
 
 		 701 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  36.64 
 
 		 688 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  35.16 
 
 		 703 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  36.94 
 
 		 720 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  42.37 
 
 		 474 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  27.07 
 
 		 720 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  25.75 
 
 		 741 aa  183  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  26.55 
 
 		 711 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  26.08 
 
 		 715 aa  163  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  25.44 
 
 		 715 aa  161  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  26.33 
 
 		 714 aa  156  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  22.93 
 
 		 715 aa  146  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  24.78 
 
 		 720 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  24.05 
 
 		 715 aa  141  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  23.59 
 
 		 721 aa  124  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  25.04 
 
 		 736 aa  115  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  25.35 
 
 		 367 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0373  hypothetical protein  29.8 
 
 		 205 aa  100  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.5146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  30.31 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  27.48 
 
 		 1171 aa  84.3  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  29.85 
 
 		 1177 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 		 1124 aa  78.2  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  28.64 
 
 		 825 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  29.38 
 
 		 838 aa  71.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  33.14 
 
 		 238 aa  70.1  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  28.16 
 
 		 847 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  28.16 
 
 		 847 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  28.64 
 
 		 844 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  27.32 
 
 		 824 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 		 948 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  29.31 
 
 		 398 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  27.18 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  27.22 
 
 		 761 aa  59.7  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  25.83 
 
 		 812 aa  57.8  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3968  hypothetical protein  27.22 
 
 		 727 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0475594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  28.99 
 
 		 436 aa  53.9  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4021  hypothetical protein  28.57 
 
 		 433 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  26.09 
 
 		 449 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  30.94 
 
 		 497 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  25.28 
 
 		 448 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3230  sterol-regulatory element binding protein  47.83 
 
 		 171 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  28.49 
 
 		 235 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  24 
 
 		 176 aa  45.8  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0677  hypothetical protein  32.69 
 
 		 117 aa  45.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  25.79 
 
 		 287 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  26.06 
 
 		 441 aa  44.3  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0961  RND family efflux transporter MFP subunit  37.1 
 
 		 389 aa  44.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.348921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>