63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3180 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  100 
 
 		 688 aa  1391    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  40.79 
 
 		 703 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  38.36 
 
 		 709 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  37.9 
 
 		 709 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  36.31 
 
 		 714 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  38.27 
 
 		 709 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  37.93 
 
 		 697 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  37.7 
 
 		 701 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  37.01 
 
 		 702 aa  430  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  37.74 
 
 		 707 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  35.69 
 
 		 698 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  36.64 
 
 		 719 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  38.24 
 
 		 699 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  37.68 
 
 		 701 aa  415  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  35.69 
 
 		 701 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  36.87 
 
 		 696 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  42.11 
 
 		 474 aa  371  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  33.67 
 
 		 720 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  27.02 
 
 		 720 aa  189  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  25.19 
 
 		 741 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  27.52 
 
 		 714 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  27.98 
 
 		 715 aa  162  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  28.19 
 
 		 715 aa  158  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  27.37 
 
 		 720 aa  154  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  26.8 
 
 		 715 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  29.55 
 
 		 715 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  25.81 
 
 		 711 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  26.02 
 
 		 721 aa  132  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  26.98 
 
 		 736 aa  110  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  25.89 
 
 		 367 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  34.64 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  31.74 
 
 		 350 aa  77  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0373  hypothetical protein  29.84 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.5146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  30 
 
 		 825 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  34.75 
 
 		 1171 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  36.15 
 
 		 1177 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  33.81 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  30.71 
 
 		 1124 aa  64.7  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  29.79 
 
 		 847 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  29.79 
 
 		 847 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  29.79 
 
 		 844 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  27.86 
 
 		 838 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  34.33 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  29.41 
 
 		 948 aa  61.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  23.81 
 
 		 824 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  32.69 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  27.13 
 
 		 812 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  31.2 
 
 		 761 aa  52.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  29.35 
 
 		 450 aa  52  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.53 
 
 		 366 aa  50.8  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142053  normal  0.195363 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3230  sterol-regulatory element binding protein  50 
 
 		 171 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  25.81 
 
 		 442 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.99 
 
 		 380 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 		 366 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0453  secretion protein HlyD family protein  28 
 
 		 287 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  36.21 
 
 		 235 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 		 392 aa  44.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 317 aa  44.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5838  hypothetical protein  26.03 
 
 		 636 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1301  RND family efflux transporter MFP subunit  23.58 
 
 		 419 aa  44.3  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.837432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  22.41 
 
 		 380 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0815  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 359 aa  43.9  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.60919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>