More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1476 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 366 aa  733    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142053  normal  0.195363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.63 
 
 		 368 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000422764  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.43 
 
 		 375 aa  325  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.37122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3430  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.38 
 
 		 376 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.516107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  39.52 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  33.85 
 
 		 401 aa  225  9e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.12 
 
 		 377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  34.17 
 
 		 376 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.13 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  31.44 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  30.74 
 
 		 351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  28.72 
 
 		 404 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  29.07 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  29.07 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  27.06 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  29.05 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  28.04 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.49 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  27.52 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.17 
 
 		 362 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  24.84 
 
 		 376 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.32 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.11 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.12 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 		 356 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  28.33 
 
 		 416 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  27.74 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  28.04 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  27.74 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  27.74 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 		 336 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000138483  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.32 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  24.04 
 
 		 365 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.58 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.32 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  29.15 
 
 		 350 aa  96.7  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.71 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.33 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3081  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0305  RND family efflux transporter MFP subunit  26.56 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  26.4 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 366 aa  93.2  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.8 
 
 		 509 aa  92.8  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  26.36 
 
 		 390 aa  92.8  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  29.76 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  26.73 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0467  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  26.96 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  28.71 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  27.49 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  26.4 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1044  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0011899  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  33.33 
 
 		 322 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  28.34 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  26.86 
 
 		 373 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.2 
 
 		 419 aa  89.4  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.91 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0341  RND family efflux transporter MFP subunit  25.24 
 
 		 375 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.666034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  27.02 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.93 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  29.23 
 
 		 538 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  25.84 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  25.88 
 
 		 375 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.64 
 
 		 390 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  27.67 
 
 		 380 aa  87.4  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  24.3 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  23.38 
 
 		 368 aa  86.7  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  27.14 
 
 		 348 aa  87  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.81 
 
 		 400 aa  86.7  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.87 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  27.41 
 
 		 386 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  28.62 
 
 		 384 aa  86.3  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.68 
 
 		 354 aa  86.3  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  27.84 
 
 		 401 aa  86.3  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  26.37 
 
 		 424 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  26.35 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_004310  BR0276  transporter, putative  26.4 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  27.4 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  25.87 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  27.15 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2034  RND family efflux transporter MFP subunit  27.16 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.83 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  26.73 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0290  putative transporter  25.83 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  25.96 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  26.02 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>