More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0305 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0305  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 378 aa  767    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0341  RND family efflux transporter MFP subunit  42.81 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.666034  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0276  transporter, putative  45.73 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0290  putative transporter  45.39 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2795  RND family efflux transporter MFP subunit  40.67 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2034  RND family efflux transporter MFP subunit  39.48 
 
 		 403 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2816  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.6 
 
 		 403 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.66 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2224  multidrug efflux pump, membrane fusion protein  37.58 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0900  RND family efflux transporter MFP subunit  37.58 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2269  RND family efflux transporter MFP subunit  37.83 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0264196  normal  0.209917 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01700  RND family efflux system membrane fusion protein  27.3 
 
 		 328 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  27.83 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  30.89 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  27.67 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  28.28 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 		 365 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1156  RND family efflux transporter MFP subunit  28.1 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000311518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  28.7 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  24.27 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  26.61 
 
 		 350 aa  106  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 		 361 aa  105  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  0.00000151053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5959  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.71 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  28.03 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  27.86 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  27.71 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  26.42 
 
 		 392 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  27.64 
 
 		 360 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  24.72 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  26.75 
 
 		 349 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.82 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.59 
 
 		 355 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 		 361 aa  99.4  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  26.56 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  25 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  26.43 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  25.3 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  27.62 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  26.43 
 
 		 360 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  27.62 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  26.43 
 
 		 360 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1851  RND family efflux transporter MFP subunit  26.81 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000181813  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1389  HlyD family secretion protein  28.36 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379904  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  26.3 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000542821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1266  RND family efflux transporter MFP subunit  28.52 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000032302  hitchhiker  0.00027333 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7712  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 		 383 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0766  HlyD family secretion protein  27.27 
 
 		 392 aa  96.7  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.59 
 
 		 372 aa  96.3  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.14 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.28 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.36 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142053  normal  0.195363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000232808  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  24.83 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  26.92 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.18 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  27.24 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  26.41 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  24.12 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  25.15 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  26.04 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1365  RND family efflux transporter MFP subunit  25.36 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000256097  hitchhiker  0.000707959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  26.62 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  26.57 
 
 		 372 aa  93.6  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  26.57 
 
 		 369 aa  93.2  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 		 360 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  28.1 
 
 		 365 aa  92.8  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.2 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  26.89 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  26.3 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  25.52 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  24.09 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  25.56 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  25.55 
 
 		 406 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  26.37 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.14 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  24.84 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  25.52 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  23.66 
 
 		 357 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 		 394 aa  90.5  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  27.11 
 
 		 372 aa  90.1  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0816  HlyD family secretion protein  27.64 
 
 		 328 aa  89.7  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  24.38 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 361 aa  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  24.85 
 
 		 377 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  23.19 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  24.5 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  25.3 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  25 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.05 
 
 		 387 aa  87  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>