More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01736 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 349 aa  695    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  52.87 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  45.16 
 
 		 392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.67 
 
 		 355 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  42.24 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  40.94 
 
 		 360 aa  257  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000542821  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  45.54 
 
 		 361 aa  256  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  43.52 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  43.52 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  45.67 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  45.67 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.67 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  47.02 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  42.49 
 
 		 361 aa  249  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  0.00000151053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  42.95 
 
 		 353 aa  249  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  45.58 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  43.67 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  43.65 
 
 		 360 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  40.96 
 
 		 361 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  41.47 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000232808  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  40.18 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1851  RND family efflux transporter MFP subunit  41.06 
 
 		 361 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000181813  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.16 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  39.32 
 
 		 360 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.66 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  35.28 
 
 		 366 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01922  RND efflux membrane fusion protein  38.16 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2001  secretion protein HlyD  37.14 
 
 		 375 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.167131  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.63 
 
 		 388 aa  199  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3081  RND family efflux transporter MFP subunit  39.41 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  37.26 
 
 		 360 aa  195  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  36.23 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  35.95 
 
 		 340 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  33.22 
 
 		 365 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  33.99 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  35.14 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 366 aa  179  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.02 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  33.68 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 369 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.14 
 
 		 369 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  33.55 
 
 		 350 aa  176  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  32.47 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  32.48 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  34.3 
 
 		 372 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  33.66 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  31.38 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1156  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 		 370 aa  169  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000311518  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  31.87 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  32.3 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  33.98 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  33.98 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  33.66 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  29.85 
 
 		 390 aa  165  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  30.29 
 
 		 359 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.3 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1145  hypothetical protein  29.89 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.75 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  33.44 
 
 		 366 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  32.58 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1266  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 		 371 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000032302  hitchhiker  0.00027333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.33 
 
 		 363 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.33 
 
 		 363 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1969  RND family efflux transporter MFP subunit  33.44 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.728278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  32.38 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  32.48 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  32.38 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  32.49 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  29.78 
 
 		 372 aa  156  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  30.51 
 
 		 372 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  31.34 
 
 		 376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  32.99 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  32.02 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.74 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  28.16 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.38 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1637  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.56 
 
 		 377 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  29.91 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  29.77 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  31.46 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.69 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  32.72 
 
 		 378 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  27.68 
 
 		 368 aa  152  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  29.48 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 372 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.28 
 
 		 377 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  28.81 
 
 		 368 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  34.97 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2174  RND family efflux transporter MFP subunit  29.95 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.290725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  32.08 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 		 372 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  34.63 
 
 		 365 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>