More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2781 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
372 aa  738    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  68.82 
 
 
372 aa  519  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  62.23 
 
 
376 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  57.18 
 
 
376 aa  415  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  52.43 
 
 
369 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.67 
 
 
374 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  57.22 
 
 
377 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.68 
 
 
377 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1637  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.42 
 
 
377 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  54.39 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  45.53 
 
 
366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  42.31 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  42.86 
 
 
371 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  40.7 
 
 
373 aa  259  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  46.03 
 
 
365 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.07 
 
 
372 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.58 
 
 
380 aa  256  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  43.71 
 
 
376 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  41.6 
 
 
383 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5959  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.13 
 
 
383 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42426  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  41.72 
 
 
379 aa  247  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.37 
 
 
370 aa  245  9e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  36.81 
 
 
376 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  36.89 
 
 
375 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.48 
 
 
363 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.48 
 
 
363 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7712  RND family efflux transporter MFP subunit  40.37 
 
 
383 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  38.22 
 
 
365 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3371  secretion protein HlyD  41.61 
 
 
370 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165029  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.85 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  38.02 
 
 
382 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 
382 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  37.5 
 
 
406 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  38.1 
 
 
394 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  41.3 
 
 
381 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  38.11 
 
 
382 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 
397 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  39.46 
 
 
397 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0787  hypothetical protein  34.61 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0758  hypothetical protein  34.61 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  40.94 
 
 
397 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  36.65 
 
 
403 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  38.49 
 
 
403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2174  RND family efflux transporter MFP subunit  36.69 
 
 
394 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.290725  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  35.56 
 
 
397 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  37.04 
 
 
382 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  36.94 
 
 
381 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2846  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  39.69 
 
 
396 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  39.1 
 
 
365 aa  202  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  33.88 
 
 
372 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  39.16 
 
 
365 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  39.16 
 
 
365 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  36.99 
 
 
360 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  39.16 
 
 
365 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  39.16 
 
 
365 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  39.16 
 
 
365 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  39.16 
 
 
365 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  39.16 
 
 
365 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.18 
 
 
368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  35.54 
 
 
372 aa  196  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2802  multidrug/cation efflux pump, membrane fusion protein subunit  37.9 
 
 
391 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1497  RND family efflux transporter MFP subunit  37.9 
 
 
391 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.432966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  33.12 
 
 
372 aa  192  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  32.51 
 
 
372 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  32.8 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  33.43 
 
 
367 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1154  RND family efflux transporter MFP subunit  36.84 
 
 
375 aa  189  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  35.08 
 
 
366 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  33.88 
 
 
372 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  34.5 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.29 
 
 
362 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  34.5 
 
 
368 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  34.29 
 
 
373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  35.69 
 
 
368 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  34.65 
 
 
374 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.41 
 
 
370 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.01 
 
 
365 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  38.01 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.8 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.8 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  33.87 
 
 
360 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  37.37 
 
 
365 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  33.63 
 
 
354 aa  169  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.81 
 
 
356 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1050  hypothetical protein  37.55 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  32.75 
 
 
351 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 
390 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  32.46 
 
 
351 aa  162  9e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2619  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
405 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.62 
 
 
388 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  32.51 
 
 
392 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  34.1 
 
 
434 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  34.69 
 
 
467 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09530  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.71 
 
 
370 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  32.14 
 
 
376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  34.18 
 
 
340 aa  156  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.68 
 
 
362 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  35.92 
 
 
415 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0614  membrane fusion protein  31.2 
 
 
404 aa  153  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  31.25 
 
 
349 aa  152  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>