More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0703 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 355 aa  686    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  45.33 
 
 		 361 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  44.74 
 
 		 360 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.74 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  44.74 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  45.05 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  45.05 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  44.44 
 
 		 360 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  45.05 
 
 		 360 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  44.03 
 
 		 385 aa  285  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000232808  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  46.3 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  44.61 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  44.44 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  42.09 
 
 		 360 aa  280  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000542821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  44.89 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  44.01 
 
 		 349 aa  272  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  42.43 
 
 		 361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  0.00000151053 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  42.17 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1851  RND family efflux transporter MFP subunit  43.93 
 
 		 361 aa  262  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000181813  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  38.05 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.71 
 
 		 368 aa  236  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  42.82 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.45 
 
 		 371 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  46.2 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  41.69 
 
 		 376 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01922  RND efflux membrane fusion protein  42.18 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  39.31 
 
 		 374 aa  206  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  35.37 
 
 		 417 aa  195  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  39.39 
 
 		 364 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  34.89 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  36.18 
 
 		 366 aa  183  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2001  secretion protein HlyD  32.21 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.167131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  32.71 
 
 		 350 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  30.77 
 
 		 359 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  31.64 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  31.64 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  34.95 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.64 
 
 		 369 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  33.55 
 
 		 390 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  36.56 
 
 		 360 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  31.71 
 
 		 369 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  34.49 
 
 		 352 aa  175  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  38.11 
 
 		 354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  31.36 
 
 		 372 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3081  RND family efflux transporter MFP subunit  37.88 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.1 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  34.01 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  35.86 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  36.91 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  36.91 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  31.69 
 
 		 406 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  29.97 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  36.91 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  36.91 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  36.91 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  36.91 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  36.91 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  31.69 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  33.65 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  29.69 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.79 
 
 		 362 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1156  RND family efflux transporter MFP subunit  33.92 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000311518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  31.07 
 
 		 369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  35.91 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  30.9 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.11 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  32.9 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  32.9 
 
 		 373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  32.57 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  33.87 
 
 		 382 aa  162  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  36.28 
 
 		 467 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  34.3 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  29.97 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  33.24 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2174  RND family efflux transporter MFP subunit  33.13 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.290725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  30.05 
 
 		 382 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  32.43 
 
 		 375 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  29.18 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  28.05 
 
 		 368 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  29.46 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  31.59 
 
 		 351 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  31.3 
 
 		 351 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  30.92 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  32.26 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.93 
 
 		 357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  30.12 
 
 		 372 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  27.98 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.94 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  29.04 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  29.65 
 
 		 372 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1969  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 		 418 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.728278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  35.06 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.47 
 
 		 362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  26.87 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1266  RND family efflux transporter MFP subunit  32.3 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000032302  hitchhiker  0.00027333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  29.06 
 
 		 373 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1365  RND family efflux transporter MFP subunit  32.2 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000256097  hitchhiker  0.000707959 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.81 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>