More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1848 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 538 aa  1079    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  53.67 
 
 		 520 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  53.67 
 
 		 520 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  46.47 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  51.76 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.11 
 
 		 531 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  68.33 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  51.8 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  63.19 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  52.38 
 
 		 489 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  50.45 
 
 		 491 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  50.11 
 
 		 489 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  50.23 
 
 		 488 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  50.11 
 
 		 489 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  50.11 
 
 		 489 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  51.82 
 
 		 489 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  52.05 
 
 		 516 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  61.81 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  49.89 
 
 		 484 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  51.82 
 
 		 489 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  52.27 
 
 		 489 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  51.82 
 
 		 489 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  51.82 
 
 		 489 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  61.27 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  59.53 
 
 		 407 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  50.23 
 
 		 491 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  42.11 
 
 		 509 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  57.97 
 
 		 401 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  56.73 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  56.43 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  54.49 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  53.63 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  54.55 
 
 		 404 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  56.47 
 
 		 404 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  54.55 
 
 		 416 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  54.55 
 
 		 416 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  54.55 
 
 		 416 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  58.26 
 
 		 397 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  54.25 
 
 		 416 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  42.22 
 
 		 502 aa  351  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  50.88 
 
 		 410 aa  326  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  50.43 
 
 		 421 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  45.53 
 
 		 400 aa  297  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.49 
 
 		 457 aa  229  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  35.59 
 
 		 459 aa  227  5.0000000000000005e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.02 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.64 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.15 
 
 		 454 aa  209  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  35.54 
 
 		 459 aa  206  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  35.13 
 
 		 424 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  36.99 
 
 		 423 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.36 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  33.99 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.05 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  34.22 
 
 		 399 aa  183  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.59 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  33.04 
 
 		 398 aa  181  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  34.39 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  37.13 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.84 
 
 		 459 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2568  secretion protein HlyD  35.45 
 
 		 389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1888  secretion protein HlyD  34.1 
 
 		 399 aa  163  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.440468  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  35.76 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1019  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 456 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  38.86 
 
 		 308 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.94 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1456  secretion protein HlyD  39.8 
 
 		 330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.134538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1849  secretion protein HlyD  40.3 
 
 		 327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134036  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 399 aa  144  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08530  efflux system component, RND family  27.13 
 
 		 419 aa  140  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104956  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.28 
 
 		 424 aa  140  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2345  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.31 
 
 		 331 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2372  HelB protein  36.27 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7182  putative cation efflux system protein czcB  38.69 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  29.78 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  32.48 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  29.35 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3342  secretion protein HlyD  35.75 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 472 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  30.36 
 
 		 403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2143  secretion protein HlyD  36.27 
 
 		 328 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1045  HelB protein  33.68 
 
 		 417 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.72 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4155  RND family efflux transporter MFP subunit  36.9 
 
 		 313 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  32.27 
 
 		 683 aa  130  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  29.03 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  32.35 
 
 		 504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.68 
 
 		 376 aa  127  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  36.79 
 
 		 329 aa  127  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.99 
 
 		 460 aa  127  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1853  secretion protein HlyD  28.99 
 
 		 471 aa  126  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  31.09 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2578  secretion protein HlyD  30.81 
 
 		 385 aa  126  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  30.52 
 
 		 379 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  31.86 
 
 		 390 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  27.14 
 
 		 382 aa  126  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  29.86 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.24 
 
 		 359 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  29.66 
 
 		 390 aa  123  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>