More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2320 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 399 aa  779    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  35.36 
 
 		 400 aa  183  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  31.62 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  33.7 
 
 		 398 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  33.16 
 
 		 399 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.23 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  33.03 
 
 		 503 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  33.8 
 
 		 401 aa  162  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  31.93 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  35.8 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.42 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1888  secretion protein HlyD  36.73 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.440468  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.01 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  30.28 
 
 		 520 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  30.28 
 
 		 520 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  34.58 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  31.55 
 
 		 484 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  34.58 
 
 		 491 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  29.64 
 
 		 410 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  34.58 
 
 		 489 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  34.58 
 
 		 489 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  31.04 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  31.01 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  31.79 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  32.45 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 538 aa  153  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.74 
 
 		 427 aa  153  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.14 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  33.53 
 
 		 459 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.42 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  32.16 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.3 
 
 		 428 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.46 
 
 		 454 aa  149  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  28.53 
 
 		 509 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  29.2 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.02 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  32.52 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.81 
 
 		 587 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.73 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  32.3 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  32.94 
 
 		 489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  30.18 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  33.23 
 
 		 516 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  32.94 
 
 		 489 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  32.94 
 
 		 489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  32.94 
 
 		 489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  32.94 
 
 		 489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  32.94 
 
 		 489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  29.54 
 
 		 423 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  32.84 
 
 		 421 aa  140  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  31.46 
 
 		 416 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  31.46 
 
 		 416 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  31.46 
 
 		 416 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  31.46 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  32.66 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  29.41 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  31.78 
 
 		 491 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  29.31 
 
 		 422 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  29.6 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.71 
 
 		 424 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  32.74 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2568  secretion protein HlyD  31.62 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  34.45 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.41 
 
 		 531 aa  120  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1019  secretion protein HlyD  31.32 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194662  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.28 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.28 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  32.95 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  28.09 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  32.24 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  26.65 
 
 		 468 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  27.59 
 
 		 413 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  31.48 
 
 		 344 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  28.39 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  28.37 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  27.17 
 
 		 466 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  30.56 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  26.1 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  35.23 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  27.75 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  29.09 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  27.48 
 
 		 550 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 		 451 aa  103  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  26.15 
 
 		 529 aa  103  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  29.75 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  30.68 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  25.43 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.77 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3647  secretion protein HlyD  34.01 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  25.58 
 
 		 581 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  27.83 
 
 		 386 aa  99.8  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  28.12 
 
 		 384 aa  99.8  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.86 
 
 		 465 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  25.6 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>