More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3518 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 376 aa  756    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  56.06 
 
 		 371 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  56.25 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  49.56 
 
 		 385 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  50.44 
 
 		 382 aa  326  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  35.01 
 
 		 418 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.13 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.6 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  36.39 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  34.25 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  33.53 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.36 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.53 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.1 
 
 		 359 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  32.1 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  37.03 
 
 		 421 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1177  secretion protein HlyD  36.08 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  34.54 
 
 		 398 aa  156  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  33.33 
 
 		 405 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  32.7 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.44 
 
 		 517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  33.11 
 
 		 399 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.04 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.49 
 
 		 512 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  35.11 
 
 		 540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  33.73 
 
 		 401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  31.48 
 
 		 440 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  31.64 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  32.63 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  32.81 
 
 		 503 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.4 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.79 
 
 		 465 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.71 
 
 		 537 aa  143  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  37.82 
 
 		 253 aa  143  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1876  secretion protein HlyD  32.89 
 
 		 375 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  32.39 
 
 		 468 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  33.66 
 
 		 407 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  33.55 
 
 		 484 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  33.02 
 
 		 538 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  33.23 
 
 		 537 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  31.71 
 
 		 537 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  33.12 
 
 		 484 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  29.34 
 
 		 472 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  31.03 
 
 		 466 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  31.76 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  32.08 
 
 		 489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  32.2 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  32.08 
 
 		 489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  31.96 
 
 		 484 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.87 
 
 		 454 aa  136  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  31.76 
 
 		 489 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  31.76 
 
 		 491 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  29.28 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.02 
 
 		 459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  32.81 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  32.21 
 
 		 520 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  31.72 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  32.21 
 
 		 520 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  30.05 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.92 
 
 		 671 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  31.55 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.54 
 
 		 457 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.98 
 
 		 364 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.07 
 
 		 421 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.93 
 
 		 362 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  27.67 
 
 		 368 aa  129  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.32 
 
 		 405 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.82 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  28.37 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.07 
 
 		 417 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  28.07 
 
 		 417 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  31.96 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.91 
 
 		 587 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  31.93 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  35.6 
 
 		 715 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  32.49 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  33.68 
 
 		 538 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  27.54 
 
 		 361 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  29.51 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  30.72 
 
 		 504 aa  126  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0019  RND family efflux transporter MFP subunit  31.72 
 
 		 382 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.47 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0105666  normal  0.0985719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.03 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  32.7 
 
 		 546 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  33.11 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  29.8 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  31.85 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  28.24 
 
 		 472 aa  124  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  29.8 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  29.8 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  29.8 
 
 		 416 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  31.65 
 
 		 489 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.79 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.45 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  31.96 
 
 		 516 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.68 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.09 
 
 		 568 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  31.33 
 
 		 489 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  31.65 
 
 		 489 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.09 
 
 		 526 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>