More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1241 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  92.87 
 
 		 421 aa  754    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  99.76 
 
 		 417 aa  847    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 417 aa  849    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  51.7 
 
 		 413 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.56 
 
 		 412 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  49.29 
 
 		 416 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  46.65 
 
 		 418 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  45.83 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  40.94 
 
 		 440 aa  315  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  30.68 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3470  HlyD family heavy metal efflux pump  32.09 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5320  heavy metal cation tricomponent efflux protein ZniB  31.04 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  30.59 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  32.2 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 384 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 384 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.905544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.16 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.389098 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.88 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  30.42 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  29.61 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  29.58 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2753  RND family efflux transporter MFP subunit  30.32 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.853922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  28.44 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  29.81 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1301  RND family efflux transporter MFP subunit  26.1 
 
 		 419 aa  140  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.837432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  27.61 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  30.57 
 
 		 418 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.65 
 
 		 456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  26.51 
 
 		 377 aa  136  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.91 
 
 		 382 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.321467  normal  0.9163 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4284  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.91 
 
 		 382 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  31 
 
 		 504 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  27.84 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  29.03 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.34 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.65 
 
 		 465 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  27.95 
 
 		 405 aa  133  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.34 
 
 		 362 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  32.68 
 
 		 253 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 705 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.79 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0105666  normal  0.0985719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  29.51 
 
 		 527 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 410 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  29.79 
 
 		 504 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  29.5 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.91 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  27.41 
 
 		 500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  25.98 
 
 		 361 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 		 512 aa  126  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  25.84 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.39 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.18 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  27.03 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  24.93 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.64 
 
 		 365 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  29.83 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.09 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  29.6 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  29.08 
 
 		 399 aa  122  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.72 
 
 		 359 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  25.66 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  29.27 
 
 		 540 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.56 
 
 		 460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  28.27 
 
 		 344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  27.45 
 
 		 517 aa  120  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  29.84 
 
 		 402 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  27.59 
 
 		 546 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1305  secretion protein HlyD  24.81 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  25.87 
 
 		 424 aa  119  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  26.82 
 
 		 629 aa  119  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  28.89 
 
 		 371 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1177  secretion protein HlyD  29 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 		 537 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.3 
 
 		 538 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 		 459 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.35 
 
 		 671 aa  116  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.72 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.29 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.22 
 
 		 568 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  27.01 
 
 		 537 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.78 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  29.73 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  25.69 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.53 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1501  component of copper transport system  22.7 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252405  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.15 
 
 		 457 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  24.4 
 
 		 561 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  26.38 
 
 		 491 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  28.25 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  25.63 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  26.01 
 
 		 640 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  27.62 
 
 		 502 aa  107  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  27.92 
 
 		 581 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  31.78 
 
 		 625 aa  107  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1019  secretion protein HlyD  28.9 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>