More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0830 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  100 
 
 		 368 aa  746    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.3 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.98 
 
 		 359 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0105666  normal  0.0985719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.89 
 
 		 374 aa  325  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.74 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.38 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  44.82 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.62 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.54 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.46 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4294  RND family efflux transporter MFP subunit  36.49 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.74 
 
 		 364 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  30.72 
 
 		 398 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  31.72 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  28.75 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  28.8 
 
 		 399 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.91 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  29.32 
 
 		 424 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.17 
 
 		 428 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.19 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  29.68 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  31.53 
 
 		 423 aa  149  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  28.71 
 
 		 405 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.03 
 
 		 400 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  28.26 
 
 		 413 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  28.88 
 
 		 440 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  29.34 
 
 		 253 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  27.04 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  28.36 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.38 
 
 		 373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  27.33 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  28.09 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  24.59 
 
 		 403 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  24.27 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  26.3 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 		 376 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  29.59 
 
 		 371 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.21 
 
 		 421 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1876  secretion protein HlyD  26.47 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  27.78 
 
 		 385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  28.62 
 
 		 537 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  28.07 
 
 		 546 aa  126  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.87 
 
 		 537 aa  126  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  25.93 
 
 		 390 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  27.88 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 538 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  26.71 
 
 		 416 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  28.53 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.54 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  26.16 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  28.43 
 
 		 527 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  26.54 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 512 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.3 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.02 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  28.75 
 
 		 529 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.9 
 
 		 456 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  26.87 
 
 		 422 aa  119  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  26.69 
 
 		 418 aa  119  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  25.08 
 
 		 379 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1177  secretion protein HlyD  25.2 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  29.19 
 
 		 468 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  25 
 
 		 418 aa  116  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3470  HlyD family heavy metal efflux pump  25.08 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.87 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  25.93 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  25.56 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  26.35 
 
 		 491 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.38 
 
 		 531 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  27.39 
 
 		 672 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.6 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  27.9 
 
 		 451 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  27.88 
 
 		 629 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 		 404 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 489 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 489 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  25.83 
 
 		 489 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  26.09 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.53 
 
 		 459 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  28.85 
 
 		 491 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  23.58 
 
 		 407 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  23.41 
 
 		 439 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  26.32 
 
 		 488 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.41 
 
 		 439 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.23 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  27.91 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  27.09 
 
 		 504 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  26.1 
 
 		 538 aa  110  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  24.4 
 
 		 484 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  27.85 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  24.31 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  25.3 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  24.51 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  27.05 
 
 		 466 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  25.56 
 
 		 484 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  27.15 
 
 		 504 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>