More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0019 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0019  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 382 aa  744    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1766  heavy metal efflux system protein, putative  35.54 
 
 		 376 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36 
 
 		 587 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 		 421 aa  133  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  31.27 
 
 		 405 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.72 
 
 		 376 aa  126  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  32.04 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  31.39 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  33.44 
 
 		 371 aa  119  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.38 
 
 		 428 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.78 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  30.11 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  30.23 
 
 		 424 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  26.43 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  30.12 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.29 
 
 		 427 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  31.42 
 
 		 404 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.99 
 
 		 406 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  31.42 
 
 		 404 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.99 
 
 		 406 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  31.1 
 
 		 537 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  30.8 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  30.41 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  30.87 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  29.09 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  28.38 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  29.8 
 
 		 416 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  29.8 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  29.8 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  29.14 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  27.3 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  29.77 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  29.8 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.58 
 
 		 512 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  27.15 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  33.57 
 
 		 540 aa  106  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  29.19 
 
 		 484 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  29.19 
 
 		 484 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  29.02 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  26.18 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.73 
 
 		 517 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  29.22 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  31.74 
 
 		 538 aa  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  31.42 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  28.23 
 
 		 538 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  29.11 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.62 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1876  secretion protein HlyD  29.46 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  37.57 
 
 		 546 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  31.08 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 		 537 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  27.65 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  28.23 
 
 		 537 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1305  secretion protein HlyD  28.9 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 		 459 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.85 
 
 		 459 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  30.67 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1177  secretion protein HlyD  30.24 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 		 581 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  31.31 
 
 		 527 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  28.53 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3470  HlyD family heavy metal efflux pump  26.77 
 
 		 375 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  26.48 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  28.71 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  29.14 
 
 		 456 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.17 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  30.82 
 
 		 407 aa  97.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.8 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  28.35 
 
 		 504 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  29.18 
 
 		 526 aa  96.3  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5274  RND family efflux transporter MFP subunit  29.26 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0726879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  27.34 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  27.37 
 
 		 365 aa  95.5  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 504 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  31.46 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1888  secretion protein HlyD  32.12 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.440468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  26.69 
 
 		 416 aa  93.2  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.23 
 
 		 671 aa  93.2  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 		 412 aa  92.8  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1239  RND family efflux transporter MFP subunit  31.01 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  29.05 
 
 		 625 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  29.93 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.87 
 
 		 705 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.09 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  29.35 
 
 		 500 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.96 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 		 454 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  28.11 
 
 		 467 aa  89.4  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 502 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  29.29 
 
 		 253 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  27.91 
 
 		 472 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.62 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.08 
 
 		 454 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.81 
 
 		 421 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  30.81 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  27.36 
 
 		 382 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4358  secretion protein HlyD  29.08 
 
 		 472 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>