More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2719 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  100 
 
 		 365 aa  726    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.55 
 
 		 372 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  36.33 
 
 		 368 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4189  secretion protein HlyD  34.08 
 
 		 432 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.934665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.79 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6239  putative cation efflux membrane fusion protein  29.97 
 
 		 375 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2800  secretion protein HlyD  31.71 
 
 		 356 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.58 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50904  normal  0.396278 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4376  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.58 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.49 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98485  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5682  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein NimB  33.52 
 
 		 366 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00246104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5654  secretion protein HlyD  33.54 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3919  RND family efflux transporter MFP subunit  32.2 
 
 		 373 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  28.7 
 
 		 484 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  28.7 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  28.29 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  27.9 
 
 		 538 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0007  secretion protein HlyD  23.86 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0298949  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.98 
 
 		 353 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000602446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0142  secretion protein HlyD  31.22 
 
 		 357 aa  105  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.59 
 
 		 454 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  26.54 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.03 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  26.04 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  28.15 
 
 		 459 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.01 
 
 		 457 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  26.47 
 
 		 416 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  24.62 
 
 		 440 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  26.47 
 
 		 416 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  26.47 
 
 		 416 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  26.47 
 
 		 416 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.96 
 
 		 607 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  28.16 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  25.86 
 
 		 379 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  25.85 
 
 		 386 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  25.77 
 
 		 489 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  24.65 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  28.01 
 
 		 405 aa  96.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  25.49 
 
 		 489 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  25.49 
 
 		 489 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  25.49 
 
 		 489 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  25.77 
 
 		 516 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  25.49 
 
 		 489 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  25.49 
 
 		 489 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  26.79 
 
 		 422 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  28.08 
 
 		 488 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0019  RND family efflux transporter MFP subunit  26.86 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  26.32 
 
 		 491 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  25.07 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 		 406 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 		 406 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  25.16 
 
 		 520 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 		 489 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  26.19 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  25.16 
 
 		 520 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  27.45 
 
 		 489 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  26.8 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  29.58 
 
 		 402 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  24.03 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  24.56 
 
 		 484 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  25.34 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 		 457 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  27.65 
 
 		 491 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  23.61 
 
 		 398 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 489 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  25.89 
 
 		 418 aa  89.4  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.26 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  25.68 
 
 		 503 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  26.54 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  25.58 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  25.69 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  26.5 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 		 468 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  26.99 
 
 		 344 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  26.01 
 
 		 456 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  27.59 
 
 		 395 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  23.1 
 
 		 396 aa  86.3  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.16 
 
 		 627 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.3 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  27.16 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0205  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.48 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130265  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.09 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  25.58 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.1 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.26 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  26.12 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  26.19 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 		 456 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  24.84 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  27.3 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.46 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3647  secretion protein HlyD  29.21 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.547068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>