More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0514 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 393 aa  769    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  26 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  26.26 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  27.27 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.46 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.65 
 
 		 400 aa  106  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  29.5 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  27.22 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  26.1 
 
 		 398 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  26.36 
 
 		 386 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.99 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.53 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.53 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  25.66 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.11 
 
 		 427 aa  96.7  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.84 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  26.36 
 
 		 418 aa  94  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  27.35 
 
 		 418 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  29.14 
 
 		 399 aa  93.2  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 		 411 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  25.83 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  27.38 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1239  RND family efflux transporter MFP subunit  26.99 
 
 		 451 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  25.86 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 457 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  23.93 
 
 		 379 aa  89.4  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  28.26 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  30.55 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.43 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0205  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.02 
 
 		 378 aa  87.4  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130265  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.88 
 
 		 373 aa  88.2  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1511  membrane-fusion protein  21.48 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000121317  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  21.94 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  28.82 
 
 		 401 aa  86.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0162  cation efflux system protein  22.39 
 
 		 389 aa  86.3  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.002148  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.09 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.87 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2578  secretion protein HlyD  27.7 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1019  secretion protein HlyD  29.28 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194662  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  26.43 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.43 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  26.55 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.25 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.3 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  31.37 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.46 
 
 		 580 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  27.53 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  26.83 
 
 		 509 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1766  heavy metal efflux system protein, putative  26.89 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  29.88 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  27.45 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.85 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3345  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.38 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  28.09 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  25.77 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  27.51 
 
 		 537 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  22.08 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  27.76 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.64 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02033  Secretion protein HlyD  29.68 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.31595  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 		 627 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  29.76 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  28.24 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  29.68 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.14 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  29.68 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  26.85 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.67 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  25.47 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  28.53 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  28.39 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  28.17 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1301  RND family efflux transporter MFP subunit  27.66 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.837432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  27.1 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.65 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  26.35 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.37 
 
 		 671 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  25.33 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.06 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.61 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.85 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0105666  normal  0.0985719 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  25.63 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.56 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  27.54 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>