175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1681 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 368 aa  735    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98485  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4376  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.23 
 
 		 361 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.23 
 
 		 361 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50904  normal  0.396278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5682  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein NimB  33.97 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00246104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3919  RND family efflux transporter MFP subunit  35.47 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5654  secretion protein HlyD  34.42 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  30 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2800  secretion protein HlyD  32.33 
 
 		 356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0142  secretion protein HlyD  31.51 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6239  putative cation efflux membrane fusion protein  27.19 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4189  secretion protein HlyD  25.6 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.934665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  25.48 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.83 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.59 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0205  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.04 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130265  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  25.62 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  24.71 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  24.83 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  24.71 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.95 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  25.22 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  24.33 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  25.52 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  25.69 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  24.42 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  30.43 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  29.73 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2568  secretion protein HlyD  25.66 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 		 587 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  25.15 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  24.56 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  24.56 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  21.73 
 
 		 502 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0162  cation efflux system protein  25.55 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.002148  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  25.47 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  24.65 
 
 		 561 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.37 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  32.02 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  26.81 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2578  secretion protein HlyD  25.85 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  22.52 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.45 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  25.94 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  24.72 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  25.94 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5136  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.51 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0007  secretion protein HlyD  21.25 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0298949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  22.7 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  23.16 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  23.86 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  23.38 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.91 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  26 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  27.35 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0146  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.33 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.12 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  22.66 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  24.83 
 
 		 484 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.92 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000602446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  22.85 
 
 		 538 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.35 
 
 		 1462 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  24.5 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.88 
 
 		 471 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.02 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  23.97 
 
 		 488 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  23.97 
 
 		 489 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  23.97 
 
 		 489 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  25.33 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  21.25 
 
 		 418 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2147  secretion protein HlyD  22.84 
 
 		 393 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  24.5 
 
 		 405 aa  52.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  27.68 
 
 		 407 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 		 403 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  24.15 
 
 		 516 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  20.98 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  23.57 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  23.47 
 
 		 491 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  23.63 
 
 		 489 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  23.57 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  23.57 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  23.57 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  23.57 
 
 		 489 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.31 
 
 		 366 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  23.23 
 
 		 489 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  22.45 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3647  secretion protein HlyD  27.87 
 
 		 318 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.54 
 
 		 459 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  22.45 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  22.45 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.88 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  21.65 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  23.29 
 
 		 491 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  22.45 
 
 		 416 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.53 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>