222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1460 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 355 aa  665    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  35.82 
 
 		 368 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.08 
 
 		 372 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  33.44 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4189  secretion protein HlyD  35.23 
 
 		 432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.934665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.63 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2800  secretion protein HlyD  35.38 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6239  putative cation efflux membrane fusion protein  29.63 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4376  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.94 
 
 		 361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.94 
 
 		 361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50904  normal  0.396278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5682  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein NimB  32.84 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00246104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0142  secretion protein HlyD  34.94 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  30.2 
 
 		 368 aa  109  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98485  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5654  secretion protein HlyD  33.53 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.67 
 
 		 353 aa  92.8  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000602446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3919  RND family efflux transporter MFP subunit  35.24 
 
 		 373 aa  92.8  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0205  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130265  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  28.9 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  28.21 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  28.25 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4463  RND family efflux transporter MFP subunit  21.63 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  26.5 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  28.66 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.13 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.13 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.26 
 
 		 390 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  28.4 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  27.57 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  25.21 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  29.49 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  21.73 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  24.66 
 
 		 561 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  28.36 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  29.11 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0146  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.01 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  29.57 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.29 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0007  secretion protein HlyD  24.65 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0298949  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6135  proton antiporter metal efflux protein SilB  25.97 
 
 		 521 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.31 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  27.38 
 
 		 484 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  26.54 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.03 
 
 		 671 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.44 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.321467  normal  0.9163 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4284  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.44 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  25.51 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  25.24 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  23.29 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3012  secretion protein HlyD  38.57 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811928 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  26.33 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  27.01 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.58 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.77 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.26 
 
 		 424 aa  59.3  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  26.93 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.16 
 
 		 607 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.73 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  24.4 
 
 		 578 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  22.97 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.11 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.11 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  26.81 
 
 		 397 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  27.06 
 
 		 384 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2568  secretion protein HlyD  28.48 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0162  cation efflux system protein  21 
 
 		 389 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.002148  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  25.41 
 
 		 520 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  25.41 
 
 		 520 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.96 
 
 		 409 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.14 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3932  RND family efflux transporter MFP subunit  21.48 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772133  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  28.62 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  27.5 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1305  secretion protein HlyD  24.72 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.55 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 627 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  22.75 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.75 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01671  membrane-fusion protein  24.53 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1044  nodulation protein NolF  29.3 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.991845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  25.95 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1700  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.95 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2036  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0261077  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  28.22 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  26.01 
 
 		 468 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  27.48 
 
 		 491 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 		 523 aa  53.1  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3176  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.51 
 
 		 426 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.44 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0019  RND family efflux transporter MFP subunit  28.19 
 
 		 382 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2710  RND family efflux transporter MFP subunit  33.98 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  24.58 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>