More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2727 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 380 aa  788    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.79 
 
 		 381 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3932  RND family efflux transporter MFP subunit  49.21 
 
 		 376 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772133  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4463  RND family efflux transporter MFP subunit  51.16 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0162  cation efflux system protein  35.25 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.002148  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.84 
 
 		 411 aa  236  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.41 
 
 		 416 aa  235  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1511  membrane-fusion protein  34.52 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000121317  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.9 
 
 		 424 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3176  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.85 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.3 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.46 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  31.02 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3345  RND family efflux transporter MFP subunit  29.97 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  31.2 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0146  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.62 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  27.51 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  26.89 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  27.32 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  24.66 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  22.77 
 
 		 502 aa  97.1  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  24.63 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.17 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  27.17 
 
 		 416 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  24.74 
 
 		 400 aa  92.8  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  24.36 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  27.62 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  24.64 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.62 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  24.56 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  24.78 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.34 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.321467  normal  0.9163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  25.07 
 
 		 410 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4284  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.34 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  24.72 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 531 aa  86.7  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  23.68 
 
 		 403 aa  86.3  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  23.32 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  22.83 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.37 
 
 		 580 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  23.99 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1305  secretion protein HlyD  24.77 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.81 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  23.91 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  23.78 
 
 		 484 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 503 aa  82.8  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  24.82 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  25.98 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  30.25 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  21.9 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.43 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  24.08 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1301  RND family efflux transporter MFP subunit  23.23 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.837432  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  22.73 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  21.68 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.32 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  23.68 
 
 		 520 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  23.68 
 
 		 520 aa  79.3  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2352  chemiosmotic efflux system C protein B  29.58 
 
 		 322 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  23.6 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1102  secretion protein HlyD  23.51 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  25.93 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2578  secretion protein HlyD  22.25 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  26.52 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  23.37 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  22.92 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  23.08 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  21.01 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2064  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  29.63 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  21.79 
 
 		 504 aa  76.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.38 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  23.46 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  22.26 
 
 		 529 aa  76.3  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  22.68 
 
 		 517 aa  76.3  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  22.57 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.73 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  21.31 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  23.21 
 
 		 484 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  23.51 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6239  putative cation efflux membrane fusion protein  24.43 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  23.01 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.32 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.32 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.27 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.47 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  23.18 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0715  putative cation efflux system protein  20.72 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.43 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  21.93 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23 
 
 		 512 aa  73.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  25 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.02 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  25.69 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  22.65 
 
 		 416 aa  72.8  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  24.16 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  21.92 
 
 		 538 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.92 
 
 		 537 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  25.53 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  23.1 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>