More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1374 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  71.05 
 
 		 489 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  89.27 
 
 		 489 aa  769    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  88.58 
 
 		 489 aa  764    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  89.27 
 
 		 489 aa  769    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  88.61 
 
 		 489 aa  768    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  89.04 
 
 		 516 aa  769    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  74.94 
 
 		 488 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  70.84 
 
 		 489 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  100 
 
 		 484 aa  954    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  89.27 
 
 		 489 aa  769    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  71.05 
 
 		 489 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  70.12 
 
 		 491 aa  685    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  89.27 
 
 		 489 aa  769    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  73.42 
 
 		 491 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  52.15 
 
 		 520 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  52.15 
 
 		 520 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  49.89 
 
 		 538 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  43.41 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  58.53 
 
 		 401 aa  388  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  57.77 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  47.05 
 
 		 484 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  55.36 
 
 		 407 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  56.3 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.12 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  46.82 
 
 		 484 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  52.52 
 
 		 416 aa  359  6e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.5 
 
 		 531 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  54.73 
 
 		 422 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  53.55 
 
 		 424 aa  349  8e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  51.49 
 
 		 416 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  51.49 
 
 		 416 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  51.49 
 
 		 416 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  51.49 
 
 		 416 aa  339  8e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  54.17 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  53.1 
 
 		 404 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  53.1 
 
 		 404 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  53.39 
 
 		 397 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  52.68 
 
 		 404 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  48.52 
 
 		 410 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  39.69 
 
 		 509 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  41.34 
 
 		 502 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  45.43 
 
 		 421 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  43.1 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.06 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.71 
 
 		 454 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.7 
 
 		 454 aa  226  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.96 
 
 		 457 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  39.65 
 
 		 459 aa  221  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  35.77 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 400 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  38.71 
 
 		 423 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  38.06 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  34.69 
 
 		 424 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  32.25 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1888  secretion protein HlyD  34.77 
 
 		 399 aa  172  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.440468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  32.26 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  35.67 
 
 		 418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.08 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.77 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.86 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.97 
 
 		 587 aa  157  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  33.63 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1019  secretion protein HlyD  33.94 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194662  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  30.1 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.96 
 
 		 376 aa  137  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.75 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0616  RND family efflux transporter MFP subunit  36.74 
 
 		 329 aa  133  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  29.61 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  32.84 
 
 		 382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7265  putative cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcB (cation efflux system protein czcB)  34.11 
 
 		 315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0692053  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1456  secretion protein HlyD  36.98 
 
 		 330 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.134538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2568  secretion protein HlyD  32.36 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1849  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.79 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4531  secretion protein HlyD  35.51 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7182  putative cation efflux system protein czcB  36.46 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.16 
 
 		 359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  32.47 
 
 		 308 aa  127  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  31.68 
 
 		 402 aa  127  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  32.67 
 
 		 371 aa  127  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2345  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.32 
 
 		 331 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1045  HelB protein  35.83 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4294  RND family efflux transporter MFP subunit  29.6 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3342  secretion protein HlyD  34.21 
 
 		 331 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2143  secretion protein HlyD  34.39 
 
 		 328 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  36.32 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  29.34 
 
 		 388 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3647  secretion protein HlyD  34.92 
 
 		 318 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0666  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  23.64 
 
 		 441 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.188115  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4155  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 		 313 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259995 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2372  HelB protein  35.29 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  28.52 
 
 		 390 aa  117  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  30.65 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.97 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  30.45 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2578  secretion protein HlyD  31.58 
 
 		 385 aa  113  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5136  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.23 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  30.89 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.04 
 
 		 512 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>