More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4463 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4463  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 391 aa  794    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.75 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.16 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3932  RND family efflux transporter MFP subunit  45.01 
 
 		 376 aa  342  5.999999999999999e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772133  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0162  cation efflux system protein  37.8 
 
 		 389 aa  275  9e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.002148  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.62 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3176  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.1 
 
 		 426 aa  252  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1511  membrane-fusion protein  34.47 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000121317  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.9 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.53 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.85 
 
 		 415 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  32.87 
 
 		 396 aa  189  8e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 409 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 392 aa  183  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3345  RND family efflux transporter MFP subunit  29.79 
 
 		 421 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0146  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.6 
 
 		 394 aa  166  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  24.93 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  25.24 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.96 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  23.56 
 
 		 403 aa  99.8  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  23.6 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  25.16 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  22.87 
 
 		 399 aa  96.3  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  23.78 
 
 		 410 aa  96.3  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  25.13 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  22.16 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.07 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4284  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.19 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.19 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.321467  normal  0.9163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  24.38 
 
 		 423 aa  93.2  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.53 
 
 		 427 aa  92.8  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.8 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.8 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  22.35 
 
 		 424 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  22.57 
 
 		 398 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  22.73 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  23.77 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2578  secretion protein HlyD  22.8 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  22.47 
 
 		 509 aa  88.6  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  24.3 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2800  secretion protein HlyD  25 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  24.85 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  21.07 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  24.55 
 
 		 368 aa  87  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  22.29 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.58 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.58 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.01 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  22.54 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  26.69 
 
 		 582 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1301  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.837432  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  24.56 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  22.53 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  22.26 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.99 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  26.75 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.1 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0105666  normal  0.0985719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.02 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  25.72 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  22.04 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  25.09 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  20.99 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  20.99 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  20.99 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  26.38 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.87 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4294  RND family efflux transporter MFP subunit  22.13 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2352  chemiosmotic efflux system C protein B  28.4 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  20 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  21.58 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.35 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  24.09 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  20.99 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  28.31 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  20.86 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2064  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  27.5 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1305  secretion protein HlyD  22.12 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  21.61 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  22.95 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.5 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.58 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  20.77 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  23.08 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  21.21 
 
 		 502 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6239  putative cation efflux membrane fusion protein  22.87 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.64 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.03 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  24.5 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.45 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1876  secretion protein HlyD  21.97 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.49 
 
 		 497 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  25.5 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1156  RND family efflux transporter MFP subunit  21.45 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.820375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.19 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  22.03 
 
 		 503 aa  73.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  24.09 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  22.4 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 451 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.33 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>