181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5654 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5654  secretion protein HlyD  100 
 
 		 362 aa  701    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.99 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50904  normal  0.396278 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4376  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.99 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5682  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein NimB  65.12 
 
 		 366 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00246104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3919  RND family efflux transporter MFP subunit  62.31 
 
 		 373 aa  353  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98485  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  34.58 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0142  secretion protein HlyD  37.35 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.14 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6239  putative cation efflux membrane fusion protein  29.89 
 
 		 375 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2800  secretion protein HlyD  31.49 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.57 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  32.42 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.53 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000602446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.87 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  28.82 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  27.54 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  29.69 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  31.06 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0146  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.88 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0205  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.31 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130265  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4189  secretion protein HlyD  26.16 
 
 		 432 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.934665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  32.46 
 
 		 402 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  28.69 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  28.71 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  28.97 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  29.69 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  29.69 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3012  secretion protein HlyD  31.34 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2578  secretion protein HlyD  31.49 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  30.45 
 
 		 538 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.72 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5136  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.42 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  28.2 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  32.03 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2012  secretion protein HlyD  19.88 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  29.29 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.41 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  27.7 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  28.04 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  29.97 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  29.63 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  29.63 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  29.63 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  29.63 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.13 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3957  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.59 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.53 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  30.07 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  29.36 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  27.87 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  30.07 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  29.36 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0019  RND family efflux transporter MFP subunit  31.65 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  27.5 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  27 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  29.73 
 
 		 489 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  27.3 
 
 		 398 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  29.73 
 
 		 491 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  31.54 
 
 		 503 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  27.4 
 
 		 399 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  28.49 
 
 		 484 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  23.85 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  31.49 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2710  RND family efflux transporter MFP subunit  31.06 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  26.44 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  27.33 
 
 		 395 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0007  secretion protein HlyD  20.73 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0298949  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  25.51 
 
 		 561 aa  52.8  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  28.4 
 
 		 402 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  28.35 
 
 		 546 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.14 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  34.15 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  22.66 
 
 		 392 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 537 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3765  hypothetical protein  24.72 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5274  RND family efflux transporter MFP subunit  29.4 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0726879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1305  secretion protein HlyD  24.72 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  30.79 
 
 		 517 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.44 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 		 538 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  29.41 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.59 
 
 		 349 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  31.18 
 
 		 361 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  27.1 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.33 
 
 		 380 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 537 aa  50.1  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  27 
 
 		 491 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>